Введение
Обзор литературы.
2.1 Общий план строения и особенности хлоропластных геномов д высших растений.
2.2 Закономерности эволюции хлоропластных геномов
2.3 Применение полных последовательностей хлоропластного генома для реконструкции филогении растений.
2.4 Некодирующие участки хлоропластного генома, особенности их структуры, эволюции и использование в филогенетическом анализе .
3. Материалы и методы. 40
3.1 Растительный материал. 40
3.2 Подбор праймеров для амплификации и секвенирования хлоропластного генома гречихи
3.3 Выделение ДНК, амплификация и секвенирование. 41
3.4 Сборка полной последовательности (контига) и аннотация 42
хлоропластного генома.
3.5 Выравнивание и филогенетический анализ. 43
3.6 Анализ случайных выборок и сравнение возможности использования генов для реконструкции филогении.
4 Результаты и обсуждение. 49
4.1 Опредение и анализ полной нуклеотидной последовательности хлоропластного генома гречихи. 49
4.1.1 Универсальные праймеры и возможность их использования для амплификации и секвенирования хлоропластных геномов цветковых растений.
4.1.2 Структурный и сравнительный анализ хлоропластного генома гречихи.
4.1.3 Границы инвертированного повтора хлоропластного генома гречихи и других представителей Polygonaceae.
4.2 Филогенетический анализ цветковых растений с использованием последовательностей хлоропластных генов .
4.2.1 Анализ объединенного набора из гена. "6
4.2.2 Редактирование РНК генов rpl2, ndhD и psbL и возможные пути его эволюции. 76
4.3 Анализ случайных выборок и оценка филогенетической значимости отдельных хлоропластных генов и групп генов. 79
4.4 Изучение полиморфизма некодирующих участков хлоропластной ДНК (на примере спейсера trnH-psbA) у близких видов и возможности их использования для реконструкции филогении на низком таксономическом уровне. 37
5 Заключение. 95
6 Выводы. 97
7 Список работ, опубликованных по теме диссертации. 98
8 Список литературы.
