Введение
Глава 1. Обзор литературы 18
1.1. История сравнения геномов и кариотипов позвоночных 18
1.1.1. Классическая сравнительная цитогенетика 18
1.1.2. Определение числа и морфологии хромосом 18
1.1.3. Методы дифференциальной окраски 19
1.1.4. Сравнительный хромосомный пэйнтинг 21
1.2. Происхождение и эволюция полового размножения 24
1.2.1. Недостатки и преимущества полового размножения 25
1.2.2. Типы полов 28
1.2.3. Половые конфликты и половой отбор 30
1.2.4. Различие между определением пола и половой дифференциацией 31
1.2.5. Половые хромосомы 31
1.2.6. Консервативность биохимических механизмов и генетических каскадов определения пола 33
1.2.7. Состав и эволюция половых хромосом в разных таксонах позвоночных 35
1.2.8. Дозовая компенсация 69
1.2.9. Полиплоидия и определение пола 73
1.2.10. Эволюция половых хромосом и видообразование 75
1.3. Заключение по обзору литературы 77
Глава 2. Материалы и методы 80
2.1. Приборы и материалы 80
2.1.1.Приборы 80
2.1.2. Материалы 80
2.2. Методы 84
2.2.1 Культивирование культур клеток фибробластов и получение суспензии хромосом 84
2.2.2. Приготовление препаратов метафазных хромосом 85
2.2.3. GTG-бэндинг 85
2.2.4. C-бэндинг 85
2.2.5. Ag-окраска 86
2.2.6. Получение Cot ДНК 86
2.2.7. Локализация кластеров рибосомной ДНК 86
2.2.8. Получение хромосомспецифичных библиотек ДНК 87
2.2.9. Секвенирование ДНК на капиллярном секвенаторе 93
2.2.10. Селекция хромосомспецифичной кДНК 94
2.2.11. Секвенирование на Illumina MiSeq 94
2.2.12. Анализ состава библиотек 94
Глава 3. Результаты и обсуждение 95
3.1. Эволюция половых хромосом плацентарных млекопитающих. Утрата Y-хромосомы и транслокации гоносом на аутосомы 95
3.1.1. Введение 95
3.1.2. Результаты 98
3.1.3. Обсуждение 105
3.2. Сравнение систем половых хромосом однопроходных 109
3.2.1. Введение 109
3.2.2. Результаты 110
3.2.3. Обсуждение 111
3.3. Эволюция половых хромосом чешуйчатых 111
3.3.1. Введение 111
3.3.2. Результаты 116
3.3.3 Обсуждение 140
3.4. Эволюция кариотипов и определение пола у черепах (Testudines) 147
3.4.1. Введение 147
3.4.2. Результаты и обсуждение 147
3.5. Необычная система половых хромосом хвостатых амфибий 151
3.5.1. Введение 151
3.5.2. Результаты 152
3.5.3. Обсуждение 154
3.6. Многообразие систем определения пола и их быстрая эволюция у костистых рыб 158
3.6.1. Введение 158
3.6.2. Результаты 161
3.6.3. Обсуждение 167
3.7. Определение пола у осетрообразных. Пол и полиплоидия 174
3.7.1. Введение 174
3.7.2. Результаты 175
3.7.3. Обсуждение 181
Заключение 187
Выводы 189
Список литературы 192
