ВВЕДЕНИЕ.............................................................................................................. 4
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ ...................................................................... 19
1.1. Особенности эпидемиологии инфекций, вызванных коронавирусами.... 19
1.1.1. Эпидемиологическое значение и распространенность коронавирусов 19
1.1.2. Эпидемиология новой коронавирусной инфекции ................................. 24
1.2. Эпидемиологический надзор за COVID-19 на территории....................... 30
Российской Федерации......................................................................................... 30
1.3. Молекулярно-биологические методы в системе эпидемиологического
надзора за инфекционными болезнями .............................................................. 37
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ............................ 47
2.1. Материалы исследования .............................................................................. 47
2.2. Методы исследования.................................................................................... 50
ГЛАВА 3. АНАЛИЗ ЗАБОЛЕВАЕМОСТИ НАСЕЛЕНИЯ НОВОЙ
КОРОНАВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИЕЙ НА ТЕРРИТОРИИ МОСКОВСКОЙ
ОБЛАСТИ .............................................................................................................. 59
3.1. Динамика заболеваемости новой коронавирусной инфекции на
территории Российской Федерации, г. Москвы и Московской области......... 59
3.2. Динамика уровня и структуры заболеваемости новой коронавирусной
инфекции на территории Московской области ................................................. 63
ГЛАВА 4. ДИНАМИКА И СТРУКТУРА ГЕНОВАРИАНТОВ SARS-CoV-2
НА ТЕРРИТОРИИ МОСКОВСКОЙ ОБЛАСТИ............................................... 77
ГЛАВА 5. КЛИНИКО-ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ
НОВОЙ КОРОНАВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИ (COVID-19) ............................. 86
НА ТЕРРИТОРИИ МОСКОВСКОЙ ОБЛАСТИ............................................... 86
ГЛАВА 6. РАЗРАБОТКА И ВНЕДРЕНИЕ В ПРАКТИЧЕСКУЮ
ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ АНАЛИТИЧЕСКОЙ ПЛАТФОРМЫ ДЛЯ ПРОВЕДЕНИЯ
ОПЕРАТИВНОГО И РЕТРОСПЕКТИВНОГО ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОГО
АНАЛИЗА.............................................................................................................. 97
ГЛАВА 7. СОВЕРШЕНСТВОВАНИЕ СИСТЕМЫ
ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОГО НАДЗОРА ЗА НОВОЙ КОРОНАВИРУСНОЙ
ИНФЕКЦИЕЙ (COVID-19) НА ОСНОВЕ МОЛЕКУЛЯРНОБИОЛОГИЧЕСКИХ МЕТОДОВ ИССЛЕДОВАНИЯ..................................... 106
ЗАКЛЮЧЕНИЕ ................................................................................................... 116
3
ВЫВОДЫ............................................................................................................. 124
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ............................................................. 127
ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ ............................ 128
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ................................................................................. 129
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ................................................................................... 130
