Введение
Глава 1. Эволюция белковых комплексов, имеющих в своем составе ацетилтрансферазу гистонов MYST1 —10
Предисловие 10
Структура и функция компенсасомы - комплекса, включающего в себя белки MSL1 и MOF у Drosophila 13
Основные компоненты компенсасомы 13
Дополнительные компоненты комплекса 19
Механизм работы компенсасомы 19
Комплекс MSL у других организмов? 21
Другие комплексы с участием хампина /MSL1 и ацетилтрансферазы MYST1 25
Ацетилтрансферазы MYST и апоптоз 30
Эволюционные аспекты, связанные с функционированием комплексов на основе ацетилтрансфераз.МУЗТІ 30
Современные представления о механизме функционирования хроматина согласно парадигме «сканирования хроматина» 32
Подвижность белков в ядре 33
Флуктуации доступности нуклеосом 34
«Открытые состояния», случайное связывание и общая схема ядерных процессов — 34
Глава 2: Результаты и обсуждение 37
Изучение первичной структуры хампина мыши, ее филогенетический анализ и изучение тканевой специфичности экспрессии его изоформ 37
Бактериальная продукция фрагментов хампина и получение специфических антител - 45
Изучение внутриклеточной локализации изоформ хампина и картирование участков, содержащих сигналы ядерной локализации 47
Результаты поиска белковых взаимодействий хампина и его партнеров в дрожжевой двугибридной системе 55
Анализ тканевой специфичности партнеров хампина, их краткая характеристика, филогенетический анализ 56
Бактериальная продукция партнеров хампина. Получение антител к некоторым белкам. Проблемы. 62
Разработка двухтеговой системы для экспрессии в бактериях. Свойства белков.
Оптимизация условий связьгаания на примере взаимодействия MYSTl-хампин 64
Применение двухтеговой системы для подтверждения взаимодействий и картирования
участков взаимодействий между хампином и некоторыми белками 68
Характеристика некоторых партнеров хампина и их ко-локализация в клетке 73
Необычные свойства ТТС4 и регуляция его внутриклеточной локализации 77
Внутриклеточная локализация белков NELF-C и NELF-D— 83
Глава 3: Экспериментальная часть 88
Материалы 88
Олигонуклеотидные праймеры для ПНР, использованные в работе 90
Конструирование экспрессирующих плазмидных ДНК - 92
Свойства белков, продуцированных в бактериях 94
Методы исследования 95
Выводы - 108
Благодарности 109
Список литературы 110
