ВВЕДЕНИЕ.............................................................................................................. 9
ГЛАВА 1. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР................................................................. 17
1.1 Олигопептиды.................................................................................................. 17
1.2 Линейные олигопептиды................................................................................ 18
1.2.1 Биологические свойства линейных олигопептидов ................................. 18
1.2.2 Термические и теплофизические свойства олигопептидов..................... 19
1.3 Циклические дипептиды ................................................................................ 22
1.3.1 Свойства циклических дипептидов............................................................ 22
1.4 Методы получения циклических дипептидов.............................................. 25
1.4.1 Биологические методы ................................................................................ 26
1.4.2 Синтез в растворе......................................................................................... 27
1.4.2.1 Циклизация дипептидного эфира............................................................ 27
1.4.2.2 Конденсация аминокислот ....................................................................... 28
1.4.2.3 Циклизация Аза-Виттига.......................................................................... 29
1.4.2.4 Реакция Дильса-Альдера .......................................................................... 30
1.4.3 Циклизация под действием микроволнового излучения ......................... 30
1.4.4 Циклизация на поверхности твёрдой фазы ............................................... 32
1.4.5 Твердофазная циклизация линейных дипептидов при нагревании........ 34
1.5 Механизм циклизации дипептидов ............................................................... 35
1.6 Применение наноструктур и кристаллов олигопептидов........................... 37
1.7 Молекулярная самосборка и самоорганизация............................................ 42
1.7.1 Межмолекулярные взаимодействия, реализующиеся при самосборке
олигопептидов ....................................................................................................... 42
3
1.7.2 Термодинамический и кинетический контроль процесса самоассоциации
олигопептидов ....................................................................................................... 44
1.7.3 Факторы, влияющие на самоассоциацию олигопептидов ....................... 45
1.7.3.1 Влияние температуры на самоорганизацию олигопептидов................ 46
ГЛАВА 2. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ .................................................. 52
2.1 Объекты исследования ................................................................................... 52
2.2 Совмещённый ТГ/ДСК/МС анализ............................................................... 53
2.3 Приготовление клатратов трипептида лейцил-лейцил-лейцин ................. 54
2.4 Дифференциальная сканирующая калориметрия........................................ 54
2.5 1H и 13C ЯМР спектроскопия.......................................................................... 54
2.6 Инфракрасная (ИК) спектроскопия с Фурье-преобразованием................. 55
2.7 Газовая хроматография (ГХ) с масс-спектрометрией (МС)....................... 55
2.8 Масс-спектрометрия с электроспреем.......................................................... 56
2.9 MALDI TOF масс-спектрометрия ................................................................. 56
2.10 Спектроскопия кругового дихроизма ......................................................... 57
2.11 Хирально-фазовая высокоэффективная жидкостная хроматография
(ВЭЖХ)................................................................................................................... 57
2.11 Методология изучения топохимических реакций с участием дипептидов
................................................................................................................................. 57
2.11.1 Изоконверсионные методы....................................................................... 60
2.11.2 Дифференциальные изоконверсионные методы .................................... 63
2.11.3 Интегральные изоконверсионные методы .............................................. 64
2.11.4 Модельные методы .................................................................................... 65
2.11.5 Кинетический анализ циклизации дипептидов....................................... 67
2.12 Метод рентгеновской порошковой дифрактометрии................................ 67
4
2.13 Статический метод парофазного газохроматографического анализа ..... 68
2.14 Атомно-силовая микроскопия ..................................................................... 68
2.15 Нингидриновый тест..................................................................................... 69
2.16 Люминесцентная микроскопия.................................................................... 69
2.17 Люминесцентная спектроскопия................................................................. 70
ГЛАВА 3. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ...................................................... 71
3.1 Термический анализ дипептидов................................................................... 71
3.2 Спектроскопия ЯМР ....................................................................................... 77
3.3 ИК-спектроскопия........................................................................................... 82
3.4 Результаты масс-спектрометрического исследования................................ 88
3.5 Результаты спектроскопии кругового дихроизма ....................................... 92
3.6 Результаты нингидринового теста ................................................................ 93
3.7 Зависимость температуры начала циклизации от размера боковых
заместителей дипептидов..................................................................................... 93
3.8 Результаты кинетического анализа циклизации дипептидов..................... 96
3.9 Результаты порошковой рентгеновской дифрактометрии ....................... 105
3.10 Результаты самосборки линейных и циклических дипептидов согласно
данным атомно-силовой микроскопии ............................................................. 106
3.11 Результаты люминесцентной микроскопии ............................................. 111
3.12 Результаты люминесцентной спектроскопии .......................................... 112
3.13 Термический анализ клатратов трилейцина............................................. 112
3.14 Сорбционные свойства LLL....................................................................... 114
3.15 Методика применения трипептида LLL для количественной оценки
содержания бензола в смесях............................................................................. 117
5
4.4. Результаты рентгеновской порошковой дифрактометрии трипептида и его
клатратов .............................................................................................................. 120
Заключение .......................................................................................................... 126
Список литературы ............................................................................................. 128
ПРИЛОЖЕНИЕ................................................................................................... 146
