Введение
1. Обзор литературы 14
1.1. Общая характеристика риккетсий 14
1.1.1. История изучения риккетсий 14
1.1.2. Систематика и классификация риккетсий 18
1.1.3. Морфология и физиология риккетсий 24
1.1.4 Строение генома риккетсий 27
1.1.4.1. Редукция генома как фактор патогенности риккетсий 29
1.1.4.2. Горизонтальный перенос генов 30
1.1.4.3. Плазмиды риккетсий 31
1.1.4.4. Некодирующая ДНК риккетсий 31
1.1.5. Эволюция семейства Rickettsiaceae и эндосимбиотическая теория происхождения митохондрий 32
1.1.6. Переносчики риккетсий 35
1.2. Клиническое значение риккетсий 41
1.2.1. Молекулярные механизмы патогенности риккетсий 41
1.2.1.1. Адгезия и проникновение внутрь эукариотической клетки 41
1.2.1.2. Разрушение риккетсиями мембраны фаголизосом 43
1.2.1.3. Актин-обусловленная подвижность риккетсий 43
1.2.1.4. Перепрограммирование риккетсиями апоптоза 44
1.2.1.5. Система секреции у риккетсий 45
1.2.2. Патогенез риккетсиозов 46
1.2.3. Иммунный ответ при риккетсиозах 48
1.2.4. Лабораторная диагностика риккетсиозов 51
1.3. Распространение риккетсий на территории России 54
1.4. Заключение 59
2. Материалы и методы исследования 61
2.1. Материал исследования 61
2.1.1. Исследуемые образцы клещей 61
2.1.2. Используемые олигонуклеотидные праймеры 66
2.1.3. Химические реактивы, ферменты и наборы 69
2.2. Методы исследования 70
2.2.1. Пробоподготовка и выделение ДНК 70
2.2.2. Дизайн праймеров 70
2.2.3. Постановка ПЦР 71
2.2.4. Детекция и очистка продуктов амплификации 71
2.2.5. Клонирование фрагмента гена gltA, предназначенного для использования в качестве положительного контроля 72
2.2.6. Определение нуклеотидных последовательностей 73
2.2.7. Анализ данных, полученных в ходе секвенирования 74
3. Результаты и их обсуждение 75
3.1. Разработка и апробация лабораторного варианта тест-системы для детекции ДНК риккетсий методом ПЦР в режиме реального времени 75
3.2. Изучение встречаемости и генетического разнообразия риккетсий в популяциях иксодовых клещей, обитающих на территории Томской области 83
3.3. Изучение встречаемости и генетического разнообразия риккетсий в популяциях иксодовых клещей, обитающих на территории Новосибирской области 100
3.4. Изучение встречаемости и генетического разнообразия риккетсий в популяциях иксодовых клещей, обитающих на территории Республики Коми 105
3.5. Изучение встречаемости и генетического разнообразия риккетсий в популяциях иксодовых клещей, обитающих на территории полуострова Крым 112
3.6. Заключение 122
Выводы 126
Список работ, опубликованных по теме диссертации 128
Список использованной литературы 135
Приложение 1 168
