Введение
Глава 1. Обзор литературы 12
1.1 Бактериальный фотосинтез 12
1.1.1 Пурпурные фотосинтезирующие бактерии 8
1.1.2 Устройство фотосинтезирующего аппарата 14
1.1.2.1 Фотосинтетическая единица 14
1.1.2.2 Светособирающая антенна 17
1.1.2.3 Фотоактивный реакционный центр 19
1.2 Пигмент - белковые комплексы светособирающей антенны пурпурных бактерий 20
1.2.1 Бактериохлорофилл, его модификации и их свойств 21
1.2.2 Каротиноиды и их свойства 23
1.2.3 аР-протеины 25
1.2.4 Комплекс LH1 26
1.2.5 Комплексы LH2 и LH3 27
1.3 Теоретическое описание процессов переноса энергии в антенных комплексах 31
1.3.1 Формализм Фёрстера 40
1.3.1.1 Потенциальные поверхности 40
1.3.1.2 Сильное взаимодействие 42
1.3.1.3 Слабое взаимодействие 44
1.3.1.4 Очень слабое взаимодействие 45
1.3.2. Экситонная теория для светособирающих комплексов 49
1.3.3 Экситон - фононное взаимодействие в светособирающих комплексов 53
Глава 2. Материалы и методы исследования 57
Глава 3. Спектры оптического поглощения и кругового дихроизма светособирающих комплексов из rodopseudomonas acidophila, расчитанные на основе рентгеноструктурных данных 58
3.1 Теоретическая модель 58
3.2 Результаты и обсуждения 60
Глава 4. Гипотеза о происхождении трёх полос в спектре поглощения комплекса lh2 нового типа (в800-830-850) из thiorhodospira sibirica 67
4.1 Теоретическая модель 67
4.2 Результаты и обсуждения 68
Глава 5. Моделирование стационарного спектра флуоресценции для lh2 комплекса из thiorhodospira sibirica 78
5.1 Теоретическая модель 78
5.2 Результаты и обсуждения 81
Выводы 85
Список литературы 86
Приложение
