Введение
Глава 1. Обзор литературы 11
Особенности формирования фаун древних озер 11
Микроэволюционные процессы и методы их детекции 15
Интроны. Особенности эволюции 23
Интроны в качестве филогенетических маркеров 26
Макрозообентос Байкала 32
Особенности биологии Korotnewia semenkewitschi и Gmelinoides fasciatus 39
Глава 2. Материалы и методы 43
Морфометрические измерения раковин моллюсков 43
Экстракция ДНК 43
Амплификация ДНК 44
Очистка амплифицированных фрагментов в геле легкоплавкой агарозы 46
Анализ нуклеотидных последовательностей 47
Реконструкция гаплотипов 47
Клонирование ампликонов в плазмидном векторе 48
Простирающиеся филогенетические древа 48
Построение филогенетических деревьев 49
Тесты на нейтральность мутаций 51
Статистическая обработка данных 51
Поиск высокоповторенных последовательностей в выборках ридов ценогастропод 52
Глава 3. Результаты и обсуждение 53
Филогенетические исследования амфипод надсем. Gammaroidea 53
Генетическая структура амфипод Gmelinoides fasciatus в Байкале 57
Филогенетическое исследование моллюсков подсем. Baicaliinae 66
Выбор маркера молекулярной эволюции 66
Интрон гена - субъединицы АТФ-синтазы моллюсков подсем. Baicaliinae. Структура диспергированного повтора 67
Интрон гена -субъединицы АТФ-синтазы как маркер эволюционных процессов у байкалиин 73
Интрон гена - субъединицы АТФ-синтазы моллюсков подсем. Baicaliinae 75
Объединение генетических, морфологических и экологических признаков моллюсков подсем. Baicaliinae 84
Филогеография Korotnewia semenkewitschi в Байкале 86
Таксономический статус P. michelae sp. n. 92
Филогенетическое исследование полихет рода Manayunkia 94
Заключение 103
Выводы 105
Список литературы 106
Приложение 125
