Введение
Глава 1. Обзор литературы 25
1.1. Сочетанная патология ВИЧ/ТБ 25
1.1.1. Эпидемиология сочетанной патологии ВИЧ/ТБ 25
1.1.2. Клинические особенности и диагностика туберкулеза у ВИЧ-инфицированных лиц 28
1.2. Лекарственная устойчивость M.tuberculosis 29
1.2.1. Базовые концепции и распространенность лекарственно-устойчивого туберкулеза в РФ 29
1.2.2. Механизмы формирования лекарственной устойчивости к противотуберкулезным препаратам 31
1.2.3. Основные подходы, используемые в диагностике лекарственной чувствительности M.tuberculosis 36
1.3. Молекулярная эпидемиология M.tuberculosis 40
1.3.1. Молекулярное типирование штаммов микобактерий туберкулзного комплекса 40
1.3.1.1. Генотипирование по полиморфизму длин рестрикционных фрагментов, содержащих IS6110 41
1.3.1.2. Генотипирование микобактерий туберкулезного комплекса по локусу прямых повторов (сполиготипирование) 41
1.3.1.3. Генотипирование штаммов микобактерий туберкулезного комплекса методом MIRU-VNTR 43
1.3.2. Молекулярно-эпидемиологические особенности популяции штаммов M.tuberculosis, циркулирующих в РФ 44
Результаты собственных исследований 48
Глава 2. Характеристика жизнеспособности M.tuberculosis, выделенных от ВИЧ-положительных и ВИЧ-отрицательных больных туберкулезом (по скорости и массивности роста) 48
Глава 3. Особенности фенотипической лекарственной чувствительности M.tuberculosis у пациентов с сочетанной патологией ВИЧ/ТБ 51
Глава 4. Молекулярно-генетические особенности устойчивости к противотуберкулезным препаратам M.tuberculosis, выделенных от больных с сочетанной патологией ВИЧ/ТБ 59
4.1. Спектр мутаций, ассоциированных с устойчивостью к изониазиду, рифампицину и фторхинолонам, у штаммов M.tuberculosis группы I 59
4.2. Спектр мутаций, ассоциированных с устойчивостью к изониазиду, рифампицину и фторхинолонам, у штаммов M.tuberculosis группы II 64
4.3. Сравнительный анализ генотипической резистентности штаммов M.tuberculosis групп I и II 68
Глава 5. Генетический полиморфизм штаммов M.tuberculosis 76
Заключение 95
Выводы 108
Практические рекомендации 109
Перспективы дальнейшей разработки темы 110
Список сокращений и условных обозначений 111
Список литературы 113
