Введение
Глава 1. Обзор литературы
1.1. Особенности генетического разнообразия населения Северной Евразии 14
1.2. История развития идентификации человека .16
1.3. Маркеры ДНК-идентификации
1.3.1. Микросателлиты .19
1.3.2. Однонуклеотидные замены (SNP) 23
1.4. Методы ДНК-идентификации 26
1.4.1. Детекция STR маркеров .26
1.4.2. Детекция SNP маркеров .27
1.5. Генетические особенности Х-хромосомы и использование
Х-маркеров в популяционной генетике и криминалистике 31
Глава 2. Материалы и методы
2.1. Материалы исследования .38
2.2. Маркеры
2.2.1. Характеристика используемых микросателлитных маркеров 41
2.2.2. Характеристика используемых SNP маркеров 52
2.3. Методы исследования .54
2.3.1. Выделение ДНК 54
2.3.2. Анализ STR-маркеров
2.3.2.1. Полимеразная цепная реакция 55
2.3.2.2. Генотипированием STR-маркеров 56
2.3.3.1. Секвенирование
2.3.3. Анализ SNP-маркеров 58
2.3.4. Статистические методы .67
Глава 3. Результаты и обсуждение
3.1. Частоты аллелей и генетическое разнообразие внутри популяций 70
3.1.1. Анализ STR-маркеров .70
3.1.2. Анализ SNP-маркеров
3.1.2.1. Отбор информативных SNP-маркеров .76
3.1.2.2. Анализ генетического разнообразия SNP-маркеров .81
3.2. Генетическая дифференциация популяций 84
3.2.1. Анализ STR-маркеров .84
3.2.2. Анализ SNP-маркеров .87
3.3. Генетические взаимоотношения между популяциями .89
3.3.1. Анализ STR-маркеров .89
3.3.2. Анализ SNP-маркеров .93
3.4. Корреляционный анализ генетических и географических расстояний .97
3.5. Анализ структуры неравновесия по сцеплению 100
3.5.1. Анализ STR-маркеров .100
3.5.2. Анализ SNP-маркеров .103
3.6. Криминалистические показатели 106
3.6.1. Идентификационный потенциал систем Х-хромосомных маркеров .106
3.6.1.1. Идентификационный потенциал систем Х-хромосомных маркеров в популяции русских (г. Кострома, г. Томск) . 110
3.6.1.2. Идентификационный потенциал систем Х-хромосомных маркеров в популяции тувинцев (Кызыл) .112
3.6.1.3. Идентификационный потенциал систем Х-хромосомных маркеров в популяции хантов (д. Русскинская, с. Казым) 115
3.6.1.4. Идентификационный потенциал систем Х-хромосомных маркеров в популяции казахов 116
3.6.1.5. Идентификационный потенциал систем Х-хромосомных маркеров в популяции бурят (с. Агинское, с. Курумкан) 118
3.6.1.6. Идентификационный потенциал систем Х-хромосомных маркеров в популяции сибирских татар (г. Томск) .120
3.6.1.7. Идентификационный потенциал систем Х-хромосомных маркеров в популяции хакасов (Аскизский район) .122
3.6.2. Сравнительный анализ идентификационной информативности Х-хромосомных и аутосомных систем
генетических маркеров .124
Заключение .129
Выводы 132
Список использованных источников и литературы
