Введение
Глава 1 Обзор литературы 11
1.1 Сохранение генофондов растений 11
1.1.1 Генетические процессы в популяциях 11
1.1.2 Выбор оптимальной стратегии сохранения редких видов растений 15
1.2 Молекулярно-генетические маркеры, применяемые для изучения редких видов растений 17
1.2.1 Биохимические маркеры 17
1.2.2 ДНК-маркеры 18
1.2.2.1 Молекулярно-генетические маркеры, основанные на детекции ПЦР-фрагментов 19
1.2.2.2. ДНК-маркеры, основанные на выявлении однонуклеотидных замен 25
1.3 Характеристика объектов исследования 27
1.3.1 Бельвалия сарматская (Bellevalia sarmatica Misc.) 27
1.3.2 Лук регелевский (Allium regelianum A.K. Becker ex Iljin) 31
1.3.3. Полынь беловойлочная (Artemisia hololeuca M. Bieb. ex Besser) 37
Глава 2 Материалы и методы исследования 41
2.1 Исходный материал 41
2.2 Выделение ДНК из растительных тканей 46
2.3 RAPD-анализ 47
2.4 ISSR-анализ 48
2.5 AFLP-анализ 48
2.6 NBS-профайлинг B. sarmatica и A. regelianum 49
2.7 SSR- анализ меж- и внутрипопуляционной изменчивости A. regelianum 50
2.8 Визуализация результатов амплификации 53
2.9 Амплификация и секвенирование участков ядерного и цитоплазматических геномов B. sarmatica и A. regelianum 53
2.10 Статистический анализ данных 55
Глава 3 Результаты и обсуждение 57
3.1 Анализ внутри- и межпопуляционной изменчивости Bellevalia sarmatica 57
3.1.1 Анализ полиморфизма некодирующих последовательностей ядерного и хлоропластного генома B. sarmatica 57
3.1.1.1 Анализ полиморфизма ITS- последовательностей B. sarmatica и родственных видов подсемейства Scilloideae 57
3.1.1.2 Анализ полиморфизма последовательностей хлоропластного генома B. sarmatica 61
3.1.2 Анализ внутри- и межпопуляционной изменчивости B. sarmatica методами мультилокусного анализа 62
3.1.2.1 Анализ внутри- и межпопуляционной изменчивости B. sarmatica с помощью RAPD-анализа 62
3.1.2.2 Анализ внутри- и межпопуляционной изменчивости B. sarmatica с помощью ISSR-анализа 67
3.1.2.3 Анализ внутри- и межпопуляционной изменчивости B. sarmatica с помощью AFLP–анализа 72
3.1.2.4 Анализ внутри- и межпопуляционной изменчивости B. sarmatica с помощью NBS-профайлинга 77
3.1.3 Сравнение результатов, полученных разными мультилокусными методами анализа 81
3.1.4 Обсуждение результатов, полученных при изучении генетического разнообразия B. sarmatica 84
3.2 Анализ внутри- и межпопуляционной изменчивости Allium regelianum 89
3.2.1 Анализ полиморфизма некодирующих последовательностей ядерного и хлоропластного генома A. regelianum и родственных видов Allium 89
3.2.1.1 Анализ полиморфизма последовательностей ITS1-5.8S-ITS2 A. regelianum и родственных видов Allium 89
3.2.1.2 Анализ вариабельности последовательностей хлоропластного генома A. regelianum 94
3.2.2 Анализ внутри- и межпопуляционной изменчивости A. regelianum методами мультилокусного анализа 99
3.2.2.1 Анализ внутри- и межпопуляционной изменчивости A. regelianum с помощью RAPD-анализа 99
3.2.2.2 ISSR-анализ меж- и внутрипопуляционной изменчивости Allium regelianum 106
3.2.2.3 AFLP-анализ меж- и внутрипопуляционной изменчивости Allium regelianum 112
3.2.2.4 Анализ меж- и внутрипопуляционной изменчивости Allium regelianum с помощью NBS-профайлинга 119
3.2.3 Анализ внутри- и межпопуляционной изменчивости A. regelianum методами монолокусного анализа 127
3.2.4 Сравнение результатов, полученных различными мульти- и монолокусными методами анализа 135
3.2.5 Обсуждение результатов, полученных при изучении генетического разнообразия A. regelianum 138
3.3 Анализ внутри- и межпопуляционной изменчивости Artemisia hololeuca 143
3.3.1 Анализ внутри- и межпопуляционной изменчивости A. hololeuca методами мультилокусного анализа 143
3.3.1.1 RAPD-анализ внутри- и межпопуляционной изменчивости A. hololeuca 143
3.3.1.2 ISSR-анализ меж- и внутрипопуляционной изменчивости A. hololeuca 147
3.3.1.3 AFLP-анализ меж- и внутрипопуляционной изменчивости A. hololeuca 153
3.3.2 Сравнение результатов, полученных разными мульти- и монолокусными методами анализа 160
3.3.3 Обсуждение результатов, полученных при изучении генетического разнообразия A. hololeuca 164
Заключение 168
Выводы 170
Список сокращений 172
Список литературы 174
Приложения 205
