Введение
Глава 1. Обзор литературы 11
1.1 Краткая характеристика отряда ракообразных веслоногих (Copepoda) 11
1.2 Видовой состав и экология циклопов в озере Байкал 13
1.3 Таксономические проблемы комплекса «Diacyclops/Acanthocyclops» 14
1.4 Микроэволюционные процессы у веслоногих ракообразных. Криптические виды 17
1.5 Методы филогенетического анализа 18
1.6 Эволюционные маркеры в филогении веслоногих ракообразных (Copepoda) 24
1.7 Гипотеза молекулярных часов. Эволюционное датирование у Copepoda 28
1.8 Диминуция хроматина. Методы оценки размеров геномов у пресноводных ракообразных 38
Глава 2. Материалы и методы 40
2.1 Сбор материала 40
2.2 Выделение тотальной ДНК циклопов 40
2.3 Амплификация генетических маркеров 41
2.4 Определение нуклеотидных последовательностей фрагментов ДНК 43
2.5 Компьютерный анализ нуклеотидных последовательностей ДНК 43
2.6. Молекулярно-генетический метод относительной оценки изменений размера генома с использованием ПЦР с оценкой результатов в режиме реального времени 45
Глава 3. Результаты и обсуждение 48
3.1 Оптимизация условий ПЦР 48
3.2 Определение нуклеотидных последовательностей 52
3.3 Разнообразие нуклеотидных последовательностей гена COI 58
3.4 Оценка насыщения нуклеотидных замен в 3 позиции кодона 59
3.5 Разнообразие нуклеотидных последовательностей гена 18S рРНК 60
3.6 Филогения циклопов 61
3.7 Оценка возраста исследуемых видов 73
3.8 Метод относительной оценки изменений размера генома с использованием ПЦР с оценкой результатов в режиме реального времени 75
Заключение 82
Выводы 84
Список литературы 85
Приложение А 105
Приложение Б 106
Приложение В 107
