Введение
1. Введение 5
2. Основная часть 12
2.1. Обзор литературы 12
2.1.1. Типы SNP 12
2.1.2. Генетические маркеры свиней 13
2.1.3. Маркеры воспроизводительных качеств свиней
2.1.3.1. Эстрогеновый рецептор ESR1 17
2.1.3.2. Бета-субъединица фолликулостимулирующего гормона FSHB 21
2.1.3.3. Коактиватор ядерных рецепторов 1 NCOA1 25
2.1.4. Маркеры мясных и откормочных качеств свиней 28
2.1.4.1. Гамма 3 субъединица протеинкиназы PRKAG3 32
2.1.4.2. Инсулиноподобный фактор роста 2 IGF2 36
2.1.4.3. Рецептор меланокортина 4 MC4R 39
2.1.4.4.Гипофизарный транскрипционный фактор POU1F1 45
2.1.5. Генетическая устойчивость к колибактериозу 48
2.1.5.1. Эшерихия коли рецептор ECR F18/FUT1 49
2.1.5.2. Муцин 4 MUC4 55
2.1.6. Заключение по обзору литературы 59
2.2. Материалы и методы 60
2.2.1. Материалы 60
2.2.1.1. Животные 60
2.2.1.2. Материально-техническое обеспечение исследований 64
2.2.2. Методы исследований 71
2.3. Результаты собственных исследований 76
2.3.1. Разработка и усовершенствование методик диагностики
полиморфизма генов маркеров продуктивности свиней 76
2.3.1.1. Маркеры воспроизводительных качеств 76
2.3.1.1.1. Тест-системы определения полиморфизма ESR1 на основе пиросеквенирования и ПЦР-ПДРФ анализа 77
2.3.1.1.1.1. Тест-система на основе метода пиросеквенирования 77
2.3.1.1.1.2. Тест-система на основе метода ПЦР-ПДРФ 80
2.3.1.1.2. Тест-система определения полиморфизма NCOA1 на основе ПЦР-ПДРФ анализа 83
2.3.1.2. Маркеры мясных и откормочных качеств 87
2.3.1.2.1. Тест-система определения полиморфизма PRKAG3 на основе пиросеквенирования з
2.3.1.2.2. Тест-система определения полиморфизма гена IGF2 на основе метода пиросеквенирования 92
2.3.1.2.3. Разработка тест-системы определения полиморфизма гена MC4R 95
2.3.1.2.4. Разработка тест-системы определения полиморфизма гена POU1F1 98
2.3.1.5. Разработка тест-системы определения полиморфизма гена RYR1 100
2.3.1.6. Разработка тест-системы определения полиморфизма гена ECR F18/FUT1 102
2.3.1.9. Разработка мультиплексной системы диагностики полиморфизма гена ESR1, RYR1 и ECR F18/FUT1 104
2.3.2. Исследование аллелофонда свиней различных пород по ДНК маркерам 108
2.3.2.1. ДНК-маркеры воспроизводительных качеств 108
2.3.2.1.1. Изучение полиморфизма гена ESR1 109
2.3.2.1.2. Изучение полиморфизма гена FSHB 118
2.3.2.1.3. Изучение полиморфизма гена NCOA1 123
2.3.2.2. ДНК-маркеры мясной и откормочной продуктивности 130
2.3.2.2.1. Изучение полиморфизма гена PRKAG3 130
2.3.2.2.2. Изучение полиморфизма гена IGF2 149
2.3.2.2.3. Изучение полиморфизма гена MC4R 157
2.3.2.2.4. Изучение полиморфизма гена POU1F1 164
2.3.2.3. ДНК-маркеры устойчивости к колибактериозу 170
2.3.2.3.1. Изучение полиморфизма гена ECR F18/FUT1 170
2.3.2.3.2. Изучение полиморфизма гена MUC4 176
2.3.2.4. Сравнительные исследования аллелофонда свиней и дикого кабана по ДНК-маркерам 181
2.3.3. Изучение продуктивных качеств свиней в зависимости от генетического полиморфизма исследуемых генов 184
2.3.3.1. Продуктивные качества свиней с различными генотипами по гену ESR1 185
2.3.3.2 Продуктивные качества свиней с различными генотипами по гену FSHB 188
2.3.3.3. Продуктивные качества свиней с различными генотипами по гену NCOA1 194
2.3.3.4. Продуктивные качества свиней с различными генотипами по гену PRKAG3 196
2.3.3.5. Продуктивные качества свиней с различными генотипами по гену IGF2 200
2.3.3.6. Продуктивные качества свиней с различными генотипами по гену MC4R 212
2.3.3.7. Продуктивные качества свиней с различными генотипами по гену POU1F1 220 2.3.3.8. Продуктивные качества свиней с различными генотипами по гену ECR F18/FUT1 227
2.3.3.9. Продуктивные качества свиней с различными генотипами по гену MUC4 229
3. Заключение 236
3.1. Обсуждение результатов исследований 236
3.2. Выводы 263
3.3. Практические предложения 269
Список литературы
