Введение
Глава 1. Лекарственная устойчивость микобактерий туберкулеза (обзор литературы) 15
1.1. История формирования представлений о лекарственной устойчивости микобактерий туберкулеза 15
1.2. Классификация лекарственной устойчивости микобактерий туберкулеза 19
1.3. Молекулярно-генетические механизмы устойчивости микобактерий туберкулеза к лекарственным препаратам 21
1.4. Методы диагностики лекарственной чувствительности микобактерий туберкулеза 27
1.4.1. Культуральные методы определения лекарственной чувствительности микобактерий туберкулеза 27
1.4.2. Молекулярно-генетические методы определения лекарственной чувствительности микобактерий туберкулеза 33
Резюме 40
Глава 2. Материалы и методы исследования 41
2.1. Общая характеристика материалов исследования 41
2.2. Методы исследования 43
2.2.1. Бактериологические методы исследования 47
2.2.2. Молекулярно-генетические методы исследования 51
2.2.2.1. Выделение ДНК микобактерий туберкулеза из клинического материала и лизирование культур микобактерий туберкулеза 51
2.2.2.2. Обнаружение ДНК M. tuberculosis complex методом ПЦР в режиме реального времени (ПЦР-РВ) 52
2.2.2.3. Определение ЛЧ МБТ к изониазиду, рифампицину и фторхинолонам методом биочипов 54
2.2.2.4. Типирование культур M. tuberculosis методом MIRU-VNTR 56
2.2.3. Методы статистической обработки результатов исследований 59
Резюме 60
Глава 3. Роль культуральных и молекулярно-генетических методов выявления микобактерий туберкулеза и определения их лекарственной чувствительности при исследовании резецированных участков легких и респираторного материала 61
3.1. Выявляемость микобактерий туберкулеза и определение их лекарственной чувствительности культуральными методами 61
3.2. Выявляемость микобактерий туберкулеза и определение их лекарственной чувствительности молекулярно-генетическими методами . 69
3.3. Сравнительная оценка бактериологических и молекулярно-генетических методов исследования 74
3.4. Алгоритм бактериологического исследования резецированных участков легких 79
Резюме 81
Глава 4. Сравнительный анализ биологических свойств возбудителя туберкулеза, выделенного из резецированных участков легких и респираторного материала 83
4.1. Сравнительный анализ скорости и массивности роста микобактерий туберкулеза, выделенных из операционного и респираторного материала, полученных на хирургическом этапе лечения больных 83
4.2. Сравнительный анализ лекарственной чувствительности микобактерий туберкулеза, выделенных из операционного и респираторного материала, полученных на хирургическом этапе лечения больных 84
4.3. Генотипирование микобактерий туберкулеза, выделенных из операционного и респираторного материала, полученных на хирургическом этапе лечения больных 88
4.4. Сравнительный анализ лекарственной чувствительности микобактерий туберкулеза, выделенных из операционного и респираторного материала, полученного на терапевтическом этапе лечения больных 89
Резюме 93
Глава 5. Анализ вариантов мутаций, ответственных за лекарственную устойчивость микобактерий туберкулеза, выделенных из резецированных участков легких 96
Резюме 108
Заключение 109
Выводы 116
Практические рекомендации 118
Список сокращений 119
Список использованной литературы 121
