Введение
1 Обзор литературы 9
1.1 Детекция молекулярных нарушений для целей диагностики и мониторинга некоторых онкологических патологий 9
1.1.1 Молекулярные маркеры для диагностики и мониторинга рака молочной железы 9
1.1.1.1 Ранняя диагностика рака молочной железы 10
1.1.1.2 Прогнозирование течения рака молочной железы 13
1.1.2 Молекулярные маркеры для диагностики и мониторинга рака легких 17
1.1.2.1 Ранняя диагностика рака легких 17
1.1.2.2 Прогнозирование течения рака легких 20
1.2 Методы лечения онкологических патологий молочной железы и легких. Воздействие на неопухолевые ткани 22
1.2.1 Радиотерапия в лечении рака молочной железы и рака легких 23
1.2.2 Химиотерапия в лечении рака молочной железы и рака легких 31
1.3 Источники внеклеточной ДНК 37
1.3.1 Ядерная ДНК 37
1.3.2 Митохондриальная ДНК 41
1.4 Полиморфизм ДНК человека на разных уровнях организации генома 43
1.4.1 Вариабельность мини - и микросателлитных повторов в некодирующих областях генома человека 45
1.4.2 Вариабельность микросателлитных тринуклеотидных повторов (CTG)n в 3’ - нетранслируемой области гена миотонической протеинкиназы человека 49
1.4.3 Неизвестные мутации митохондриальной ДНК 52
1.4.4 Количественные изменения нуклеиновых кислот, циркулирующих в плазме крови 56
2 Методы и материалы 59
2.1 Исследуемые группы 59
2.2 Выделение ДНК 61
2.3 Анализ вариабельности микросателлитных повторов 62
2.4 Анализ частоты аллелей (CTG)n 67
2.5 Определение доли внеклеточной митохондриальной ДНК с мутациями 68
2.6 Определение копийности ядерного ACTB и митохондриального ND1 генов 70
3 Результаты исследований и обсуждение 72
3.1 Изучение изменчивости микросателлитных повторов ДНК некодирующих областей генома 72
3.1.1 Изучение изменения уровня полиморфизма микросателлитных повторов ДНК из периферической крови в отдаленные сроки после облучения 72
3.1.2 Изучение уровня полиморфизма микросателлитных повторов после воздействия курсов радиационной и химиотерапии 78
3.1.3 Анализ частоты аллелей (CTG)n 85
3.1.4 Определение доли внеклеточной митохондриальной ДНК с мутациями 94
3.1.5 Изменение соотношения числа копий митохондриального и ядерного генов 96
4 Заключение 111
5 Выводы 112
6 Список сокращений 113
7 Список литературы 114
