Введение
Глава 1. Обзор литературы 10
1.1. Этиология и патогенез атопического дерматита 11
1.2. Гены предрасположенности к атопическому дерматиту
1.2.1 Гены цитокинов 21
1.2.2 Гены, участвующие в формировании эпидермального барьера 27
1.2.3 Гены образ-распознающих рецепторов 32
1.3. Межгенные и ген-средовые взаимодействия 38
Глава 2. Материалы и методы исследования 41
2.1.Материалы исследования 41
2.2.Методы исследования 42
2.2.1. Выделение геномной ДНК 42
2.2.2. Полимеразная цепная реакция синтеза ДНК 43
2.2.3. Рестрикционный анализ 43
2.2.4. Метод электрофореза 44
2.2.5. SSCP-анализ 44
2.2.6. Генотипирование полиморфных локусов с использованием системы OpenArray SNP Genotyping System 46
2.2.7. Статистическая обработка полученных результатов 50
Глава 3. Результаты и обсуждение 54
3.1. Анализ мутаций и полиморфных вариантов генов, участвующих в формировании эпидермального барьера, у больных атопическим дерматитом и в контрольной группе 54
3.1.1. Анализ мутаций в гене филаггрина у больных атопическим дерматитом и в контрольной группе 54
3.1.2. Мета-анализ результатов исследования мутаций гена филаггрина 66
3.1.3. Анализ полиморфных вариантов гена SPINK5 у больных атопическим дерматитом и в контрольной группе 67
3.2.Исследование полиморфных локусов генов образ-распознающих рецепторов и генов CI lor/30 и LRRC32 у больных атопическим дерматитом и в контрольной группе 75
3.2.1. Анализ ассоциации полиморфных вариантов генов образ-распознающих рецепторов и генов CI lor/ЗО и LRRC32 с развитием атопического дерматита 75
3.2.2. Анализ ассоциации гаплотипов полиморфных локусов генов образ-распознающих рецепторов, локализованных в области 4р14, с атопическим дерматитом 87
3.2.3. Мета-анализ результатов исследования полиморфных вариантов генов образ-распознающих рецепторов и генов С1 lor/ЗО и LRRC32 89
3.3.Анализ ассоциаций полиморфных вариантов генов цитокинов с атопическим дерматитом в Республике Башкортостан 94
3.3.1. Анализ полиморфного локуса rs2243250 гена IL4 у больных атопическим дерматитом и в контрольной группе 94
3.3.2. Анализ полиморфного локуса rsl800872 гена 1Ы0 у больных атопическим дерматитом и в контрольной группе 98
3.3.3. Анализ полиморфного локуса rs20541 гена IL13 у больных атопическим дерматитом и в контрольной группе 103
3.3.4. Анализ полиморфного локуса rsl805010 гена IL4R у больных атопическим дерматитом и в контрольной группе 106
3.3.5. Анализ полиморфного локуса rs 17809012 гена ССЫ1 у больных атопическим дерматитом и в контрольной группе 110
3.3.6. Анализ полиморфного локуса rsl800629 гена TNFA у больных атопическим дерматитом и в контрольной группе 114
3.4.Анализ полиморфных локусов, выявленных при полногеномных исследованиях, у больных атопическим дерматитом и в контрольной группе 118
3.5.Исследование роли межгенных взаимодействий в формировании предрасположенности к атопическому дерматиту 128
Заключение 135
Выводы 144
Список сокращений и условных обозначений 145
Список литературы
