Введение
Глава 1. Обзор литературы 15
1.1. История развития палеогенетики 15
1.2. Проблема достоверности палеогенетических результатов 16
1.2.1. Специфические свойства древней ДНК 16
1.2.2. Проблема контаминации 20
1.2.3. Верификация палеогенетических данных 21
1.3. Области применения палеогенетики 25
1.4. МтДНК как молекулярно-генетический маркер для этногенетических и палеогенетических исследований 27
1.4.1. Особенности структуры генофонда мтДНК современного коренного населения юга Сибири 30
1.4.2. Палеогенетические работы, посвященные анализу древней мтДНК человека 34
1.5. Молекулярно-генетическое установление половой принадлежности останков человека и определение степени родства древних индивидов 39
1.6. Этнокультурные сообщества на территории юга Сибири в эпоху неолита и ранней бронзы 42
1.6.1. Археологическая и антропологическая характеристика населения
Барабинской лесостепи эпохи неолита и ранней бронзы (VI – III тыс. до н.э.)
1.7. Археологическая и антропологическая характеристика населения Прибайкалья периода неолита и ранней бронзы (VI - III тыс. до н.э) 45
1.8. Археологическая и антропологическая характеристика населения афанасьевской культуры с территории Алтае-Саянской горной страны периода ранней бронзы (IV - III тыс. до н.э) 47
Глава 2. Материалы и методы 51
2.1. Материалы 51
2.1.1. Критерии формирования выборок фрагментов скелетных останков 51
2.1.2. Палеоантропологические материалы, исследованные в работе 52
2.2. Методы 53
2.2.1. Предварительная обработка посткраниального костного материала 53
2.2.2. Предварительная обработка зубов 54
2.2.3. Экстракция ДНК 54
2.2.4. Амплификация участка ГВС I мтДНК 55
2.2.5. Меры против контаминации 58
2.2.6. Клонирование продуктов ПЦР 58
2.2.7. Определение нуклеотидной последовательности ДНК 59
2.2.8. Филогенетический и филогеографический анализ полученных данных по мтДНК 60
2.2.9. Метод многомерного шкалирования 61
2.2.10. Определение профиля STR-локусов и установление половой принадлежности образцов 61
Глава 3. Результаты 62
3.1. Результаты генотипирования мтДНК представителей населения Барабинской лесостепи эпохи неолита и раннего металла (VI – начало III тыс. до н.э.) 63
3.1.1. Гаплогруппа А10 в составе генофонда мтДНК древних популяций Барабинской лесостепи эпохи бронзы 74
3.2. Результаты генотипирования мтДНК представителей населения Прибайкалья эпохи неолита и ранней бронзы (VI – начало III тыс. до н.э.) 81
3.3. Результаты генотипирования мтДНК представителей населения афанасьевской культуры Алтае-Саянской горной страны эпохи ранней бронзы (IV – начало III тыс. до н.э.) 85
3.4. Профили STR-локусов и статус молекулярно-генетических маркеров половой принадлежности представителей усть-тартасской культуры из коллективных захоронений могильника «Сопка-2» Барабинской лесостепи эпохи раннего металла (V - IV тыс. до н.э.) 89
Глава 4. Обсуждение результатов 91
4.1. Достоверность полученных экспериментальных данных 91
4.2. Структура генофонда мтДНК населения Барабинской лесостепи эпохи неолита и ранней бронзы (VI – начало III тыс. до н.э.) 93
4.2.1. Гаплогруппа А10 – возможный генетический маркер независимой локальной эволюции популяций человека в Западной Сибири 103
4.3. Формирование структуры генофонда мтДНК населения Прибайкалья эпохи неолита и ранней бронзы (VI – начало III тыс. до н.э.) 109
4.4. Структура генофонда мтДНК населения афанасьевской культуры Алтае-Саянской горной страны эпохи ранней бронзы (IV – начало III тыс. до н.э.) 113
4.5. Степень родства и половая принадлежность представителей населения усть-тартасской культуры из коллективных захоронений могильника «Сопка-2» Барабинской лесостепи эпохи ранней бронзы (V - IV тыс. до н.э.) 117
Заключение 119
Выводы 123
Список литературы 125
