Введение
1. Обзор литературы 7
1.1. Современные представления о структуре и фолдинге белков. Промежуточные и неправильно свернутые состояния, их роль в образовании нативного белка и нарушениях фолдинга 7
1.1.1. Первичная структура белка определяет его нашивную пространственную структуру и путь сворачивания 13
1.1.2. Особенности фолдинга белков в клетке 15
1.1.3. Одностадийное кооперативное сворачивание небольших белков 16
1.1.4. Сворачивание белков через образование промежуточных состояний 19
1.1.5. Модель энергетической воронки 21
1.1.6. Переходное состояние и ядро сворачивания 21
1.1.7. Развернутое состояние белка 23
1.1.8. Нативное состояние - отвечает ли оно глобальному минимуму свободной энергии 24
1.1.9. Промежуточные состояния, их роль в образовании агрегированных форм белков 26
1.2. Свойства актина в различных структурных состояниях 28
1.2.1. Собственная флуоресценция нативного актина. Микроокружение триптофановых остатков и их вклад во флуоресценцию белка 31
1.2.2. Инактивированный актин - термодинамически стабильное промежуточное состояние белка 42
1.2.3. Вторичная структура нативного и инактивированного актина 46
1.2.4. Диэлектрические и релаксационные свойства микроокружения триптофановых остатков нативного и инактивированного актина 48
1.2.5. Локализация триптофановых остатков в инактивированном актине 51
1.2.6. Гидродинамические размеры инактивированного актина 53
1.2.7. Внутримолекулярная подвижность триптофановых остатков нативного и инактивированного актина 55
1.2.8. Свойства поверхности инактивированного актина 58
1.2.9. Представляет ли инактивированныи актин структуру типа расплавленной глобулы 60
2. Материалы и методы 62
2.1. Получение, очистка и характеристика препаратов актина 62
2.2. Флуоресцентные измерения 62
2.3. Кинетические эксперименты по сворачиванию-разворачиванию актина 63
2.4. КД измерения 64
2.5 Фосфоресцентные измерения 64
3. Результаты и обсуждение 65
3.1. Кинетика денатурации актина 66
3.1.1. Существенно развернутый кинетический интермедиат, предшествующий образованию инактивированного актина 66
3.1.2. Кинетические константы процесса денатурации актина гуанидингидрохлоридом 72
З.1.З. Кинетика разворачивания актина формамидом 74
3.1.4. Кинетика образования инактивированного актина 77
3.2. Специфические взаимодействия актина с гуанидингдрохлоридом 87
3.3. Новая схема процессов сворачивания-разворачивания актина 93
Выводы 104
