Введение
1. Обзор литературы 10
1.1. Этиология и клинико-эпидемиологическая характеристика PC 10
1.1.1. Клинические признаки PC 10
1.1.2. Эпидемиология PC 10
1.1.3. Этиология PC И
1.2. Стратегии анализа генетической предрасположенности 12
1.3. Полный геномный поиск 15
1.4. Подход "ген-кандидат" 18
1.4.1. Принципы выбора "генов-кандидатов" при исследованиях PC и некоторые результаты этих исследований для отдельных генов 18
1.4.2. Ассоциации PC с несколькими полиморфными участками генома 26
1.4.3. Ассоциации полиморфных участков генома с клиническими вариантами PC 28
1.5. Сравнение результатов полного геномного поиска и подхода "ген-кандидат" и оценка перспектив исследования генетической предрасположенности к PC. 32
1.6. Обоснование выбора генов-кандидатов для PC 34
2. Материалы и методы 38
2.1. Использованные реактивы 3 8
2.2. Объект исследования 38
2.3. Организация данных 39
2.4. Выделение геномной ДНК из периферической крови 41
2.5. Геномное типирование 41
2.5.1. Геномное типирование полиморфного участка в гене CCR5 41
2.5.2. Геномное типирование полиморфного участка в положении +49 первого экзона гена CTLA4 41
2.5.3. Геномное типирование полиморфных участков в гене TGFPL 42
2.5.4. Геномное типирование других полиморфных участков 45
2.6. Статистический анализ 46
3. Результаты и обсуждение 49
3.1. Анализ полиморфизма CCRJA32 49
3.2. Анализ полиморфизма полиморфизма CTLA 4 +49 51
3.3. Анализ полиморфизма гена TGFfil 54
3.4. Поиск ассоциаций PC с сочетанием аллелей полиморфных участков с применением "стандартных" подходов на основе точного критерия Фишера 61
3.5. Поиск ассоциаций клинических вариантов PC с аллелями полиморфных участков с применением "стандартных" подходов
на основе точного критерия Фишера 64
3.6. Анализ базы данных с применением алгоритма APSampler 65
Заключение 70
Выводы 71
Список литературы
