Введение
Глава 1. Обзор литературы 12
1.1 Общая характеристика возбудителя туберкулеза и устойчивость к противотуберкулезным препаратам 12
1.1.1 Морфологические, культуральные и биохимические свойства возбудителя туберкулеза 12
1.1.2 Лекарственная устойчивость М. tuberculosis и ее типы 17
1.1.3 Молекулярно-генетические механизмы формирования резистентности М. tuberculosis к основным противотуберкулезным препаратам 18
1.2 Лабораторная диагностика туберкулеза 26
1.2.1 Фенотипические методы диагностики 26
1.2.2 Современные ускоренные молекулярно-генетические методы диагностики 32
1.2.3 Методы выявления жизнеспособных микобактерий туберкулеза в клиническом материале 36
1.3 Актуальность проблемы туберкулеза и лекарственной устойчивости в мире и в
Российской Федерации 37
ГЛАВА 2. Материалы и методы исследования 41
2.1 Объект исследования 41
2.2 Бактериологические методы 43
2.2.1. Обработка клинических образцов 43
2.2.2 Микроскопическое исследование образцов 44
2.2.3 Культуральное исследование образцов и методы идентификации 45
2.2.4 Проведение фенотипических тестов на лекарственную чувствительность 46
2.2.5 Выделение ДНК из клинических образцов и изолятов 50
2.3 Молекулярно-генетические методы з
2.3.1 Определение лекарственной чувствительности молекулярно-генетическими методами 51
2.3.2 Типирование по спейсерным олигонуклеотидам (сполиготипирование) 57
2.3.3 Определение жизнеспособности микобактерий с использованием моноазида пропидия (метод ПМА) 58
2.3. Методика ввода данных 59
2.4 Методы статистического анализа 60
ГЛАВА 3. Лекарственная устойчивость штаммов м. tuberculosis, выделенных от больных туберкулезом в самарской области, находившихся на лечении в течение 2008-2010 гг 62
3.1 Идентификация и лекарственная устойчивость штаммов М. tuberculosis, выявленная фенотипическими методами 62
3.2 Лекарственная устойчивость штаммовМ. tuberculosis, выявленная молекулярно-генетическими методами
3.2.1 Мутации, определяющие резистентность к противотуберкулезным препаратам, среди штаммов М. tuberculosis, циркулирующих в Самарской области 73
3.2.2 Оценка диагностических параметров ускоренных молекулярно-генетических методов определения чувствительности к противотуберкулезным препаратам 79
3.3 Генетические группыМ tuberculosis 91
ГЛАВА 4. Диагностика туберкулеза путем определения жизнеспособности клеток м. tuberculosis в респираторных образцах с использованием моноазида пропидия 95
ГЛАВА 5. Эпидемиологические аспекты лекарственной устойчивости в самарской области: факторы риска, влияние на исходы лечения и выживаемость пациентов 102
5.1 Факторы риска лекарственной устойчивости к препаратам первого ряда и резервным препаратам 102
5.2 Влияние спектра лекарственной устойчивости на исходы лечения и выживаемость больных туберкулезом 104
Глава 6. Оптимизация алгоритма ускоренной диагностики туберкулеза 111
Заключение 116
Выводы 120
Список использованной литературы
