Введение
Глава 1 Обзор литературы 14
1.1 Внебольничные пневмонии у лиц пожилого возраста Роль штаммов Streptococcus pneumoniae в развитии инфекций нижних дыхательных путей у пожилых людей 14
1.2 Факторы риска развития пневмонии у лиц пожилого возраста 15
1.3 Особенности этиологической структуры возбудителей инфекций респираторного тракта у лиц пожилого возраста 17
1.4 Факторы вирулентности Streptococcus pneumoniae 18
1.5 Особенности антимикробной резистентности пневмококков 22
1.6 Лечение внебольннчных пневмоний пневмококковой этиологии у лиц пожилого возраста 28
1.7 Особенности микробиологического исследования при диагностике этиологической структуры инфекций респираторного тракта 30
1.8 Устойчивость к антибактериальным химиопрепаратам микроога-низмов, выделенных при микробиологической диагностике инфекций респираторного тракта у лиц пожилого возраста 33
1.9 Распространение эпидемического варианта Streptococcus pneumoniae 34
1.10 Геном Streptococcus pneumoniae 38
1.10.1 SpPHK типирование 38
1.10.2 Мозаичные гены Streptococcus pneumoniae 39
1.10.3 Мультилокусное сиквенстипирование (MLST) 40
1.10.4 Генетические маркерыр/у и lytA 41
1.10.5 Другие генетические маркеры 43
1.10.6 Микробиологический мониторинг пневмококковых инфекци 44
1.10.7 Оценка распространения различных генотипов пневмококка в системе микробиологического мониторинга пневмококковых инфекций 44
1.10.8 Серотипирование штаммов S.pneumoniae 45
1.10.9 Генетические методы микробиологического мониторинга штаммов пневмококка 48
1.10.10 Современные аспекты диагностики пневмокковой инфекции 51
1.10.11 Молекулярно-генетические методы в диагностике пневмокковых инфекций 51
1.10.12 Основные аспекты микробиологических исследовании пневмококковой инфекции при планировании профилактических мероприятий 55
Глава 2 Направления, контингент, материал и методы исследования 59
2.1 Направления исследований 59
2.2 Контингент исследования 64
2.3 Материал для исследования 66
2.3.1 Клинический материал 66
2.3.2 Тест-штаммы 66
2.4 Методы исследования 61
2.4.1 Выделение, идентификация и дальнейшее изучение биологических свойств культур 68
2.5 Определение чувствительности к антибиотикам 70
2.5.1 Диско-диффузионный метод 70
2.5.2 Метод серийных разведений 71
2.6 Серотипирование 71
2.7 Мультилокусное сиквенстипирование MLST 71
2.8 Исследование вирулентности 73
2.8.1 Подготовка клинических образцов для исследования 73
2.8.2 Выделение ДНК микроорганизмов из исследуемых образцов 73
2.8.3 ПЦР идентификация штаммов пневмококка 74
2.9 Статистическая обработка 77
2.9.1 Статистическая обработка цифровых показателей 77
Глава 3 Заболеваемость внебольничной пневмонией лиц пожилого возраста 82
3.1 Анализ заболеваемости внебольничными пневмониями лиц пожилого возраста 82
3.2 Этиология внебольничных пневмоний у лиц пожилого возраста роль штаммов пневмококка в развитии внебольничных пневмоний 85
3.3 Результаты изучения носительства основных возбудителей внебольничных пневмоний у лиц пожилого возраста 90
Глава 4 Микробиологическая характеристика патогенности и устойчивости к антибактериальным препаратам S.pneumoniaey выделенных у лиц пожилого возраста 96
4.1 Факторы патогенности S.pneumoniae 97
4.2 Исследование устойчивости к антибактериальным химиопрепа-ратам 105
4.3 Характеристика устойчивости к антибактериальным химиопре-паратам штаммов S.pneumoniae, выделенных у больных вне-больничными пневмониями ну носителей 106
Глава 5 Мультилокусное сиквенстипирование штаммов S.pneumoniae, выделенных у лиц пожилого возраста Результаты молекулярно генетического мониторинга 114
Заключение 123
Выводы 131
Рекомендации для внедрения в практическое здравоохранение 132
Список сокращений 133
Список литературы 134
