Введение
Обзор литературы
Мониторинг чувствительности к антисептикам и дезсредствам у микроорганизмов, циркулирующих в госпитальной среде
Функциональные классы биоцидов и их антибактериальная активность
Хлоргексидин Триклозан
Использование препаратов биоцидов
Механизмы устойчивости бактерий к биоцидам
Распространенность бактерий со сниженной чувствительностью к биоцидам
Природная устойчивость к биоцидам у бактерий
Приобретенная устойчивость бактерий к биоцидам Механизмы сочетанной устойчивости бактерий к антибиотикам и биоцидам
Бактериальные биопленки и формирование резистентности к биоцидам
Биопленки бактериальных патогенов и их клиническая значимость
Механизмы и этапы формирования бактериальных биоплёнок
Молекулярные сигналы для начала формирования биопленки
Чувствительность планктонных форм бактерий и бактериальных биопленок к антибактериальным препаратам
Методы изучения биоплёнок
Заключение по обзору литературы
Материалы и методы
Микробиологические методы Штаммы микроорганизмов Питательные среды и условия культивирования Антибактериальные препараты Антибиотики Антисептики Определение чувствительности бактерий к антибактериальным препаратам Диско-диффузионный метод Определение минимальной подавляющей концентрации и минимальной бактерицидной концентрации антисептика методом микроразведений в бульоне и агаре 58
Определение минимальной подавляющей концентрации и минимальной бактерицидной концентрации антисептика методом аппликаторов 58
2.1.5 Селекция штаммов стафилококков, устойчивых к триклозану 59
2.1.6 Определение параметров роста бактерий 60
2.1.7 Моделирование бактериальных биопленок при выращивании культур на жидких и плотных питательных средах 60
2.2 Биофизические методы исследования 61
2.2.1 MALDIOF масс-спектрометрия 61
2.2.2 Анализ белковых MALDI-профилей 62
2.2.3 Атомно-силовая микроскопия 62
2.2.4 Электронная микроскопия 62
2.3 Молекулярно-генетические методы 63
2.3.1 Выделение бактериальной ДНК 63
2.3.2 Полимеразная цепная реакция 64
2.3.3 Секвенирование продуктов амплификации 65
2.3.4 Полногеномное секвенирование 65
2.4 Биоинформационные методы 66
2.4.1 Анализ амплифицированных последовательностей ДНК.. 66
2.4.2 Анализ полногеномных последовательностей ДНК 66
2.4.3 Размещение последовательностей ДНК в международных базах данных 66
2.5 Статистические методы 67
2.5.1 Статистическая обработка данных 67
2.5.2 Расчет математических показателей скорости роста колоний бактерий 67
Собственные исследования 69
ГЛАВА 3 Оценка чувствительности планктонных клеток и биопленок госпитальных штаммов бактерий к антисептику хлоргексидину 69
3.1 Разработка метода сравнения чувствительности планктонных культур и бактериальных биопленок к антисептикам на примере хлоргексидина 69
3.2 Изучение антибактериальной активности хлоргексидина в отношении госпитальных штаммов бактерий 73
3.3 Сравнительный анализ морфологии и физико-химических параметров бактериальных клеток в планктонных культурах и биопленках 78
микроскопии
3.3.1 Изучение планктонных и биопленочных культур штамма A. baumannii В-1745 с помощью атомно-силовой
3.3.2
Изучение планктонных и биопленочных культур штамма A. baumannii В-1745 с помощью электронной
Сравнение белковых спектров планктонных и биопленочных культур с помощью MALDIOF масс спектрометрии
Заключение по Главе 3
Изучение закономерностей формирования устойчивости к триклозану у staphylococcus aureus
Селекция и характеристика мутантных вариантов штамма S. aureus АТСС25923, устойчивых к триклозану Селективный отбор мутантных вариантов стафилококков, устойчивых к триклозану Изучение стабильности приобретенной устойчивости к триклозану у мутантных вариантов стафилококков ...
Оценка чувствительности к антибиотикам у стафилококков, резистентных к триклозану
Определение параметров роста колоний стафилококков, устойчивых к триклозану
Анализ структуры гена еноил-ацил-редуктазы йг/)/
Выявление мутаций в геномах штаммов S aureus, устойчивых к триклозану, с помощью полногеномного секвенирования
Заключение по Главе 4 80
Заключение
Выводы
Практические рекомендации
