Введение
ГЛАВА 1. Обзор литературы 11
1.1 Феномен гибридизации 11
1.1.1. Классификация, распространение и значимость в природе, интрогрессия 13
1.1.2. Изолирующие механизмы вида и случаи их нарушения 16
1.1.3. Гибридные зоны и их типы 19
1.2. Типы ареалов 21
1.3. Географическая изменчивость популяций 24
1.3.1. Типы генетической изменчивости 25
1.3.2. Гено- и филогеография 28
1.4. Современные методы генетики и молекулярные маркеры 31
1.4.1. Метод ПДРФ-анализа: область применения 31
1.4.2. Метод RAPD-PCR анализа: суть, область применения, преимущества и ограничения 33
1.4.3. Секвенирование и использование кодирующих последовательностей в генетических исследованиях 37
ГЛАВА 2. Материал и методы 41
2.1 Материал и места сбора образцов 41
2.2. Методы 48
2.2.1. Выделение ДНК 48
2.2.2. Анализ полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (ПДРФ) 48
2.2.3. RAPD-PCR анализ 49
2.2.4. Секвенирование 50
2.2.5. Статистический анализ 51
ГЛАВА 3. Генетические свидетельства гибридизации сусликов Spermophilusmajor и s. erythrogenys 56
3.1. Распространение и экологические адаптации S. major и S. erythrogenys 56
3.2. Сравнительный RAPD-PCR - анализ сусликов S. major и S. erythrogenys. 59
3.3. Обширная интрогрессия генов цитохрома b мтДНК S. е. hrevicauda в зоне гибридизации S. major и S. erythrogenys 73
ГЛАВА 4. Генетическое и таксономическое разнообразие домовых мышей надвида mus musculus азиатской части бывшего СССР 80
4.1. Распространение, особенности экологии и систематика домовой мыши Mils musculus 80
4.2. Распределение генетического разнообразия внутри и между локальными популяциями 85
ГЛАВА 5. Генетическая изменчивость и географическая дифференциация трех видов ворон рода corvus 102
5.1. Ареалы и биологические особенности черной Corvus согопе, серой С. comix и большеклювои С. macrorhynchos ворон 102
5.2. Особенности генетического разнообразия черной Corvus согопе, серой С. comix ворон и их фенотипических гибридов 106
5.2.1. Анализ ПДРФ геномной ДНК ворон 106
5.2.2. RAPD-PCR анализ черной, серой ворон и их гибридов 111
5.3. Филогенетические связи черной Corvus согопе, серой С. comix и большеклювои С. macrorhynchos ворон 117
5.4. Географическая и межвидовая дифференциация черной и большеклювои ворон из материковой и островной частей видовых ареалов 121
ГЛАВА 6. Обсуждение результатов 133
6.1. Особенности молекулярной организации геномов гибридов и механизмы генетической изоляции 133
6.2. Генетическое разнообразие популяций гибридизирующих форм и их фенотипических гибридов 137
6.3. Уровень и направление интрогрессии последовательностей ядерной и митохондриальной ДНК 147
Выводы 160
Литература 162
