Введение
Глава 1. ОСНОВНЫЕ ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ —17
1.1. Роль электронной микроскопии в проведении морфо-физиологических исследований — 17
1.2. Объекты исследования —25
1.3. Методы исследования —28
1.3.1. Основные микробиологические методы —28
1.3.2. Методы определения антагонистической активности —34
1.3.3. Физические методы: —36 -
УФ - и ИК - спектроскопия —36
метод ориентационной кондуктометрии —37
1.3.4. Электронно-микроскопические методы: —37
- метод позитивного окрашивания —38
- модифицированный метод позитивного окрашивания —39
- метод ультратонких срезов —39
- электронно-цитохимический метод выявления полисахаридов —39
- сканирующая электронная микроскопия (СЭМ) —40
1.3.5. Методы исследования ультраструктурной организации микробных
сообществ, выращенных на плотных питательных средах: —40
- модифицированный метод СЭМ колоний —41
- метод позитивного окрашивания отпечатков с колоний —42
- модифицированный метод ультратонких срезов колоний —42
1.3.6. Электронно-микроскопические методы исследования антагонистических взаимоотношений микроорганизмов, выращенных на плотных питательных средах —43
1.3.7. Методы исследования биодеструктивных изменений различных материалов и памятников культуры: —44
- оценка изменения структуры гранитного щебня —46
- оценка биодеструктивных изменений мрамора —47
-оценка действия биоцида —47
-оценка биодеструкции нефтепродуктов —48
-применение метода позитивного окрашивания для геоэкологической
экспертизы —50
- оценка биодеструктивных изменений памятников культуры (бумага,
пергамен, кожа) —50
1.3.8. Морфометрический метод —51
1.3.9. Статистическая обработка результатов —51
Глава 2. ГЕТЕРОГЕННОСТЬ МИКРОБНЫХ ПОПУЛЯЦИЙ 52
2.1. Обзор литературы —52
- понятие «микробная популяция» —52
- структура микробных популяций —53
- микробная экология и гетерогенность микробных популяций —55
- морфологическая гетерогенность микробных популяций —56
- регуляторные системы бактериальных популяций — система глобальной регуляции 58
2.2. Результаты исследований —61
2.2.1. Основные морфологические типы клеток —62
2.2.2. Морфологическая гетерогенность микробных популяций при различных воздействиях (повышенная температура, обезвоживание, кислотный и щелочной шоки) —65
2.2.3. Морфологическая гетерогенность микробных популяций Escherichia coli В при разных условиях выращивания —91
2.2.4. Морфологическая гетерогенность микробных популяций Brevibacterium flavum Е531 в процессе роста и биосинтеза лизина —101
2.2.5. Морфологическая гетерогенность микробных популяций Campylobacter jejuni, Campylobacter coli и Helicobacter pylori —111
Глава 3. УЛЬТРАСТРУКТУРНЫЕ ОСОБЕННОСТИ СТРОЕНИЯ МИКРОБНЫХ СООБЩЕСТВ
3.1. Обзор литературы 121
3.2 . Результаты исследований —135
3.2.1. Ультраструктура бактериальных колоний —135
3.2.2. Ультраструктура бактериальных биопленок —146
3.2.3. Ультраструктура колониеподобных сообществ —150
3.2.4. Ультраструктура смешанных микробных сообществ —158
Глава 4. ЭЛЕКТРОННО-МИКРОСКОПИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ АНТАГОНИСТИЧЕСКИХ ВЗАИМООТНОШЕНИЙ МЕЖДУ МИКРООРГАНИЗМАМИ 170
4.1. Обзор литературы —170
4.2. Результаты исследований —194
4.2.1. Электронно-микроскопическое исследование антагонистических взаимоотношений прокариотических микроорганизмов (лактобацилл, патогенных и условно-патогенных бактерий) —195
- антагонистическое воздействие лактобацилл на патогенные энтеробактерии Shigella flexneri 2а —195
- антагонистическое воздействие лактобацилл на условно-патогенные грамположительные бактерии Staphylococcus aureus и Bacillus subtilis —200
- антагонистическое воздействие энтеробактерии на лактобациллы —202
4.2.2. Электронно-микроскопическое исследование антагонистических
взаимоотношений прокариотических (лактобацилл) и эукариотических
(дрожжеподобные грибы Candida albicans) микроорганизмов —208
- антагонистическое воздействие лактобацилл на клетки С. albicans —208
- антагонистическое воздействие клеток С. albicans на клетки Lactobacillus acidophilus
Глава 5. ОСОБЕННОСТИ РАЗВИТИЯ МИКРОБНЫХ СООБЩЕСТВ НА РАЗЛИЧНЫХ СУБСТРАТАХ: ПОЧВА, МИНЕРАЛЫ, НЕФТЬ, БУМАГА, ПЕРГАМЕН, КОЖА
5 5.1. Обзор литературы 215
5.1.1. Биодеструкция минералов и трансформация почвы —215
5.1.2. Биодеструкция нефти и нефтепродуктов —221
5.1.3. Биодеструкция бумаги —228
5.1.4. Биодеструкция кожи и пергамена —230 5.2. Результаты исследований —236
5.2.1. Биогенная трансформация почвы и минералов —236
5.2.2. Биодеструкция мрамора —247
5.2.3. Биодеструкция нефти —255
5.2.4. Биодеструкция органических материалов in vivo (бумага, кожа, пергамен, кость) —265 ЗАКЛЮЧЕНИЕ —276
