Введение
Глава 1. Обзор литературы 12
1.1. Гаплотипический анализ мутаций гена GJB2: эффект основателя как основной механизм возникновения АРГ 1А типа 12
1.2. Мутация сайта сплайсинга с.-23+1G A гена GJB2 – основная генетическая причина возникновения АРГ 1А типа в Якутии 22
1.3. Гипотеза селективного преимущества гетерозиготных носителей мутаций гена GJB2 27
Глава 2. Материалы и методы 38
2.1. Выборка исследования 38
2.2. Методы молекулярно-генетического анализа 39
2.3. Статистические методы 43
2.4. Филогенетический анализ 45
2.5. Методы биоинформационного анализа 45
2.6. Методы ультразвукового исследования толщины эпидермиса и анкетирование по Бристольской шкале стула 49
2.7. Этический контроль 51
Глава 3. Результаты и обсуждение 52
3.1. Доказательства эффекта основателя по мутации c.-23+1G A гена GJB2 52
3.1.1. Реконструкция c.-23+1G A-гаплотипов по данным SNP-маркеров в популяции якутов 52
3.1.2. Реконструкция гаплотипа основателя с мутацией c.-23+1G A, по данным 9 SNP-маркеров в шести популяциях Евразии 58
3.2. Центр происхождения и пути миграции носителей мутации с.-23+1G A гена GJB2 по данным 730 000 SNP-маркеров 62
3.3. Селективное преимущество гетерозиготных носителей мутации с.-23+1G A гена GJB2 в Якутии 73
3.3.1. Сравнительный анализ толщины эпидермиса у индивидуумов с различными GJB2-генотипами по мутации с.-23+1G A 73
3.3.2. Резистентность гетерозиготных носителей мутаций с.-23+1G A гена GJB2 к диарее 78
Заключение 83
Выводы 89
Список литературы 90
Приложение А Реконструкция гаплотипов-основателей семи этно-специфических мутаций гена GJB2 120
Приложение Б Описание пяти исследуемых выборок 127
Приложение В Частота мутации c.-23+1G A среди всех мутаций гена GJB2 в популяциях мира 129
