Оглавление
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ ................................................................................. 4
Введение ................................................................................................................... 5
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ ...................................................................... 14
1.1. Общие сведения о доместикации ............................................................. 14
1.2. Полногеномные исследования доместикации животных ...................... 18
1.3. Модельные объекты в исследованиях доместикации животных .......... 23
1.4. Серые крысы как модельный объект доместикации, проведенной
путем генетической селекции по уровню агрессивности по отношению к
человеку.............................................................................................................. 27
1.5. Роль отделов мозга в контроле агрессивного поведения у
млекопитающих ................................................................................................. 43
Заключение к обзору литературы ........................................................................ 52
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ .............................................................. 54
2.1. Животные .................................................................................................... 54
2.2. Выделение РНК из тканей головного мозга крыс .................................. 56
2.3. Анализ транскриптома отделов головного мозга крыс ......................... 58
2.4. Метод полуколичественной ПЦР в реальном времени.......................... 59
2.5. Функциональный анализ дифференциально экспрессирующихся
генов (ДЭГ) ........................................................................................................ 63
2.6. Статистический анализ .............................................................................. 64
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ..................................................................................... 65
3.1. Анализ секвенирования транскриптомов в структурах головного
мозга ручных и агрессивных крыс .................................................................. 65
3.2. Верификация дифференциальной экспрессии генов в образцах
головного мозга ручных и агрессивных крыс методом
полуколичественной ПЦР в реальном времени ............................................. 76
3.3. Функциональная аннотация ДЭГ в структурах головного мозга
ручных и агрессивных крыс ............................................................................. 82
3
3.4. Сравнение ДЭГ в образцах гипоталамуса ручных и агрессивных крыс
с ДЭГ других домашних и диких животных .................................................. 95
ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ ................................................................................. 108
4.1. Характеристика ДЭГ ручных и агрессивных крыс .............................. 108
4.2. ДЭГ в отделах головного мозга ручных и агрессивных крыс в
терминах генной онтологии по базам данных DAVID и STRING ............. 115
4.3. Выявление закономерностей доместикации животных на основе
полногеномных данных .................................................................................. 122
ЗАКЛЮЧЕНИЕ ................................................................................................... 124
ВЫВОДЫ ............................................................................................................. 126
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ ................................................................................... 128
ПРИЛОЖЕНИЕ ................................................................................................... 156
