Введение
1. Обзор литературы 12
1.1. Аминоацил-тРНК-синтетазы: краткий обзор функций 12
1.2. Аминоацил-тРНК-синтетазы: два класса, семь подклассов 14
1.3. Аминоацилирование: активация тРНК 19
1.4. Взаимодействие аминоацил-тРНК-синтетаз с тРНК 22
1.5. Ингибиторы аминоацил-тРНК-синтетаз: потенциальные эффективные антибиотики 25
1.6. Аминоацил-тРНК-синтетазы: происхождение и эволюция 27
1.7. Фенилаланил-тРНК-синтетаза 32
1.7.1. Структура и свойства 32
1.7.2. Неканонические функции 36
1.7.3. Комплекс с TPHKPhe 37
1.7.4. Комплексы с Phe и PheOH-AMP 41
2. Экспериментальная часть 44
2.1. Материалы и методы 44
2.1.1. Выделение и очистка фенилаланил-тРНК-синтетазы 45
2.1.2. Кристаллизация фенилаланил-тРНК-синтетазы 47
2.1.3. Получение комплекса PheRS-Phe-AMP 48
2.1.4. Получение данных рентгеновской дифракции 48
2.2. Обработка результатов 49
2.2.1. Первичная обработка данных рентгеновской дифракции 49
2.2.2. Построение и уточнение пространственной модели 51
3. Результаты исследования 54
3.1. Выделение, очистка и кристаллизация гомогенного фермента 54
3.2. Реакция аминоацилирования в присутствии дивалентных ионов... 54
3.3. Обзор структуры функционального комплекса 57
3.4. Связывание и распознавание фенилаланин-аденилата 60
3.5. Распознавание фенилаланина в ряду ароматических аминокислот..68
3.6. Ион металла в области взаимодействия а- и В-субъединиц гетеродимера 73
3.7. Ион сульфата на поверхности ДНК-связывающего домена 74
4. Обсуждение результатов 76
Выводы 83
Литература 85
