Введение
Глава 1. Обзор литературы 11
1.1. Медико-биологическое значение дерматомицетов 11
1.2. Заболевания, вызываемые грибами родов Microsporum и Trichophyton 14
1.3. Характеристика возбудителей микроспории и трихофитии 16
1.4. Регламентированные методы лабораторной диагностики дерматомикозов 18
1.5. Применение полимеразной цепной реакции для выявления и
идентификации дерматомицетов 22
Глава 2. Материалы и методы исследований 30
2.1. Объекты исследования 30
2.2. Микологические методы исследования
2.2.1. Световая микроскопия клинического материала 31
2.2.2. Культивирование и идентификация дерматомицетов
2.3. Выделение ДНК из клинических образцов 33
2.4. Компьютерный анализ нуклеотидных последовательностей 35
2.5. Подбор олигонуклеотидных праймеров для специфической детекции ДНК M. canis, T. mentagrophytes и T. verrucosum 35
2.6. Специфическая детекция ДНК M. canis, T. mentagrophytes и T. verrucoum в клинических образцах с помощью метода ПЦР 36
2.7. Электрофоретический анализ ДНК в агарозном геле 37
2.8. Автоматическое секвенирование ДНК ферментативным методом 38
2.9. Методы статистической обработки полученных данных 39
Собственные исследования 42
Глава 3. Культурально-морфологическая характеристика дерматомицетов, выявляемых в клинических образцах 42
3.1. Результаты световой микроскопии клинического материала 42
3.2. Изучение культурально-морфологических особенностей штаммов дерматомицетов 44
Глава 4. Выбор наиболее эффективного метода выделения днк из клинических образцов 53
Глава 5. Конструирование тест-систем для пцр детекции возбудителей микроспории и трихофитии в клиническом материале 56
5.1. Поиск информативных участков ДНК для ПЦР-идентификации M. canis, T. mentagrophytes и T. verrucosum и подбор оптимальных олигонуклеотидных праймеров 56
5.2. ПЦР-идентификация M. canis и подбор оптимальных условий для эффективной амплификации специфичных участков ДНК 61
5.3. ПЦР-идентификация T. mentagrophytes и T. verrucosum и подбор оптимальных условий для эффективной амплификации специфичных участков ДНК 64
Глава 6. Выбор адекватных групп сравнения для оценки информативности используемых методов 69
Глава 7. Сравнительная оценка информативности пцр и традиционных методов лабораторной диагностики дерматомикозов 73
Заключение 81
Выводы 85
Список сокращений 87
Список литературы
