Введение
Литературный обзор 6
1.1 ДНК в нанотехнологии 8
1.1.1 Линейные ДНК в наноэлектронике 8
1.1.2 Агрегация наночастиц посредством ДНК 9
1.1.3 Разветвленные мотивы на основе ДНК 11
1.1.4 Сложные ДНК-мотивы в качестве структурных строительных блоков 11
1.1.5 Протяженные линейные ДНК, свернутые в сложные мотивы , . 14
1.1.6 Прототипы молекулярных двигателей на основе ДНК 15
1.1.7 Основанные на ДНК биосенсоры 17
1.1.8 Выводы 19
1.2 Обзор методов компьютерной химии 19
1.2.1 Различия между методами молекулярной механики, полуэмпирическими и ab initio методами 19
1.2.2 Компоненты ab initio вычислений 21
1.2.3 Базисы 22
1.2.4 Методы 24
1.2.5 Типы вычислений 25
1.2.6 Изучение растворов 28
1.2.7 Некоторые примеры использования методов компьютерной химии в современных иследованиях 28
1.3 Обзор методов двумерной ЯМР-спектроскопии 30
1.3.1 Применение современных методов ЯМР 31
1.3.2 Модернизация представления ID 13С ЯМР-спектров: DEPT . 31
1.3.3 Гомоядерная корреляционная спектроскопия: COSY 32
1.3.4 Полная корреляционная спектроскопия: TOCSY 35
1.3.5 Гетероядерная односвязная корреляционная спектроскопия: HMQCHHSQC 35
1.3.6 Спектроскопия гетероядерной корреляции через несколько связей: НМВС 37
1.3.7 Корреляции через пространство: ядерный эффект Оверхаузера и эксперимент NOESY 39
Теоретическая часть 42
2.1 Синтез псевдопептидов 43
2.1.1 Изучение стадии восстановления защищенных дикарбоновых аминокислот 43
2.1.2 Синтез псевдопептида Boc-L-Glu(7-OBzl)-\I>-GlyOAll 47
2.1.3 Синтез псевдопептида BocGly-*-IrGlu(7-OBzl)OAll 47
2.1.4 Синтез псевдопептида Cbz-L-Glu(7-0tBu)-*(Ns)-L-His(Ns)0Me . 48
2.1.5 Синтез защищенных псевдопептидов, содержащих остатки про-лина Ґ 49
2.2 Синтез мономеров 03 ПНК на основе псевдопептидов Glu-\I>-Gly и Gly-Ф-Glu 51
2.3 ЯМР-эксперименты по доказательству структуры полностью защищенных мономеров 03 ПНК на основе псевдопептидов Gly-^-Glu и Glu-*-Gly 56
Экспериментальная часть 72
3.1 Синтез защищенных /3-аминоспиртов 74
3.2 Синтез псевдопептида Glu-^-Gly 75
3.3 Синтез защищенного псевдопептида Gly-ty-Glu 76
3.4 Синтез защищенного псевдопептида Glu-^-His 79
3.5 Синтез защищенных псевдопептидов состава ProGly-Ф-Рго 81
3.6 Синтез Cbz-защищенных цитозина и аденина 85
3.7 Синтез мономеров 03 ПНК на основе псевдопептида Glu-Ф-СІу . 86
3.8 Синтез мономеров 03 ПНК на основе псевдопептида Сіу-Ф-Glu . 89
Выводы 95
Список литературы 96
