Введение
ГЛАВА I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1. Механизм репликации ДНК
1.1. Скорость репликации ДНК эукариот, единицы репликации 8
1.2. Репликативный комплекс эукариот. Мульти-ферментный комплекс синтеза предшественников ДНК. Функциональная компартментализация дезоксирибонуклеотидов 9
1.3. Прерывистый синтез ДНК. Ступенчатость синтеза. Синтез фрагментов Оказаки 12
1.3.1. Инициация синтеза фрагментов Оказаки 13
1.3.2. РНК-праймеры фрагментов Оказаки. Гетерогенность РНК-праймеров 14
1.3.3. Синтезируются ли фрагменты Оказакина обеих или на одной нити ДНК? 15
1.3.4. Ферменты синтеза фрагментов Оказаки 18
1.4. Заполнение брешей и лигирование 20
1.4.1. Ферменты, участвующие в процессе застройки брешей ( "gap filling" ) 21
1.4.2. Ингибиторы и другие факторы регуляции второго этапа репликации ДНК 23
1.4.3. Лигирование фрагментов Оказаки 25;
2. Синтез хроматина
2.1. Структура хроматина 26
2.2. Гиперчувствительность новообразованного хроматина к нуклеазам 28
2.3. Структурные особенности хроматина в репликативной вилке
2.3.1. Ступенчатое связывание гистонов с новообразованной ДНК 31
2.3.2. Модификация гистонов коровых частиц "незрелых" нуклеосом 32
2.3.3. Дефицит гистона HI во фракции "незрелых" нуклеосом. Формирование мононуклеосом с ДНК укороченной длины 34
2.3.4. Конформациошше интермедиаты вновь образованных нуклеосом 36
2.4. Характер распределения родительских и новообразованных гистонов по хроматину
при репликации
2.4.1. Модели расположения родительских и вновь синтезированных гистонов в вилке репликации 38
2.4.2. Анализ распределения новообразованных гистонов в репликативной вилке 42
2.4.3. Последовательность взаимодействия вновь образованных гистонов с ДНК
в вилке репликации 45
2.5. Динамика сборки нового хроматина 50
3. Энзиматическое метилирование ДНК при репликации
3.1. Механизм метилирования. Содержание 111 в ДНК эукариот 54
3.2, Характер метилирования ДНК высших эукариот
3.2.1. Внутригеномное распределение 55
3.2.2. Последовательности ДНК, метилируемые in vivo 57
3.3. Связь метилирования ДНК и репликации 60
3.4. Разная чувствительность метилаз к аналогам SAM-ингибиторам синтеза и метилирования ДНК 67
3.5. Метилирование ДНК и структура хроматина... 69
3.6. Биологическая функция метилирования ДНК у эукариот 73
ГЛАВА II. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ 79
ГЛАВА III. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
1. Динамика репликации ДНК в L-клетках мыши в зависимости от плотности клеток в культуральном слое 91
2. Метилирование фрагментов Оказаки и линкерных участков ДНК« Локализация дополнительного метилирования ДНК 103
3. Метилирование ДНК в присутствии s -изобутил-тиоаденозина (SIBA)
5. формирование нуклеосом на фрагментах Оказакидо их лигирования 121
6. Реплжативное метилирование ДНК в присутствии циклогексимида 124
7. Схема репликативного метилирования ДНК 129
ВЫВОДЫ 136
