Введение
Обзор литературы (Роль структурно-специфических взаимодействий в формировании транскрипционных комплексов) 5
1.Общие представления о механизмах инициации транскрипции б
1.1 .Характеристика РНК-полимеразы 7
1.2.Структурная организация промоторов 11
1.3. Общие представления о механизмах взаимодействия РНК-полимеразы с промотором 15
2.Особенности ДНК-белковых взаимодействий в транскрипционных комплексах 18
2.1.Топологическая характеристика полимераза-промоторных комплексов 19
2.2.Пространственная организация транскрипционного комплекса 22
2,3. Особенности взаимодействия а-субъединиц РНК-полимеразы с промоторами 24
3. Конформационные свойства ДНК 29
3.1. Конформационные свойства ДНК 29
3.2. Роль легкодеформируемых динуклеотидов в активации транскрипции 32
3.3. Деформация ДНК в комплексах с белками 34
Заключение
Материалы и методы 40
Результаты и их обсуждение 47
1. Локализация участка температуро-зависимых конформационных перестроек в промоторе 47
2. Структурно-функциональная роль динуклеотидов ТА, находящихся между местами взаимодействия а-субъединиц. 53
2.1. Функциональная характеристика 54
2.2. Структурная характеристика комплексов, формируемых РНК-полимеразой с Т7ЛД 60
2.3. Зависимость матричных свойств промотора T7D от положения кинкообразующего динуклеотида ТА 63
3. Структурно-функциональная роль динуклеотидов ТА, находящихся в участках непосредственного контакта с а-субъединицами РНК-полимеразы. 67
3.1. Структурно-функциональная характеристика TlD.32k 68
3.2. Структурно-функциональная характеристика Т7 73
Общее заключение 76
Выводы 81
Список литературы 82
Список сокращении 97
