ВВЕДЕНИЕ..................................................................................................................... 4
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ........................................................................... 16
1.1. Эпидемиологический надзор за ВИЧ-инфекцией в Российской Федерации16
1.2. Генетическая вариабельность и лекарственная устойчивость ВИЧ-1.......... 17
1.2.1. Механизмы возникновения лекарственной устойчивости ВИЧ-1.......... 21
1.2.2. Распространенность лекарственной устойчивости ВИЧ-1...................... 27
1.2.3. Методы определения лекарственной устойчивости ВИЧ-1 .................... 29
1.2.4. Базы данных лекарственной устойчивости ВИЧ-1................................... 31
1.3. Эпидемиологический надзор за распространением лекарственноустойчивых вариантов ВИЧ-1 .................................................................................. 33
1.3.1. Осуществление надзора за лекарственной устойчивостью ВИЧ-1 в мире
.................................................................................................................................. 33
1.3.2. Осуществление надзора за лекарственной устойчивостью ВИЧ-1 в
Российской Федерации .......................................................................................... 37
1.4. Применение молекулярно-биологических и биоинформатических методов
при изучении эпидемии ВИЧ-инфекции................................................................. 40
СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ .................................................................... 44
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ .............................. 44
ГЛАВА 3. ДИНАМИКА УРОВНЯ И СТРУКТУРЫ ЗАБОЛЕВАЕМОСТИ
ВИЧ-ИНФЕКЦИЕЙ И ОХВАТ ОКАЗАНИЕМ МЕДИЦИНСКОЙ ПОМОЩИ
И ЛЕЧЕНИЕМ ЛИЦ, ЖИВУЩИХ С ВИЧ, В РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
И ОРЛОВСКОЙ ОБЛАСТИ..................................................................................... 64
3.1. Динамика уровня и структуры заболеваемости ВИЧ-инфекцией в
Российской Федерации и Орловской области ........................................................ 64
3.2. Охват оказанием медицинской помощи и лечением лиц, живущих с ВИЧ, в
Российской Федерации и Орловской области ........................................................ 70
ГЛАВА 4. ХАРАКТЕРИСТИКА ГЕНЕТИЧЕСКИХ ВАРИАНТОВ ВИЧ-1 ... 74
ГЛАВА 5. РАСПРОСТРАНЕННОСТЬ ЛЕКАРСТВЕННОЙ
УСТОЙЧИВОСТИ ВИЧ-1 И МУТАЦИЙ РЕЗИСТЕНТНОСТИ ..................... 79
5.1. Распространенность лекарственной устойчивости ВИЧ-1 и мутаций
резистентности среди пациентов без опыта приема антиретровирусных
препаратов .................................................................................................................. 79
5.2. Распространенность лекарственной устойчивости ВИЧ-1 и мутаций
резистентности среди пациентов с опытом приема антиретровирусных
препаратов .................................................................................................................. 86
3
ГЛАВА 6. ФАКТОРЫ РИСКА, АССОЦИИРОВАННЫЕ С НАЛИЧИЕМ
РЕЗИСТЕНТНЫХ ВАРИАНТОВ ВИЧ-1............................................................... 97
ГЛАВА 7. АНАЛИЗ КЛАСТЕРОВ ПЕРЕДАЧИ ВИЧ-1.................................... 103
ГЛАВА 8. СОВЕРШЕНСТВОВАНИЕ ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОГО
НАДЗОРА ЗА РАСПРОСТРАНЕНИЕМ ЛЕКАРСТВЕННО-УСТОЙЧИВЫХ
ВАРИАНТОВ ВИЧ-1 ПУТЕМ РАЗВИТИЯ РОССИЙСКОЙ БАЗЫ ДАННЫХ
УСТОЙЧИВОСТИ ВИЧ К АНТИРЕТРОВИРУСНЫМ ПРЕПАРАТАМ И
РАЗРАБОТКИ МЕТОДОВ АНАЛИЗА КЛАСТЕРОВ ПЕРЕДАЧИ ВИРУСА
....................................................................................................................................... 134
ЗАКЛЮЧЕНИЕ......................................................................................................... 141
ВЫВОДЫ.................................................................................................................... 159
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ................................................................ 161
ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ............................. 163
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ ..................................................................................... 164
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ....................................................................................... 167
ПРИЛОЖЕНИЯ ........................................................................................................ 185
