Введение
ГЛАВА 1. Обзор литературы 19
1.1. Синдром линча 19
1.1.1. Клиническая картина пациентов с синдромом Линча 19
1.1.2. Молекулярные нарушения при синдроме Линча 23
1.1.3. Наследственные мутации при синдроме Линча 27
1.1.4. Методы отбора пациентов для диагностики синдрома Линча 28
1.1.5. Клинический и молекулярный мониторинг и лечебная тактика у 31 пациентов с синдромом Линча
1.1.6. Факторы, влияющие на риск развития рака при синдроме Линча 35
1.1.7. Химио и таргетная терапия при синдроме Линча 36
1.1.8. Семейный колоректальный рак X типа 38
1.2. Аденоматозные полипозные синдромы 39
1.2.1. Клиническая картина семейного аденоматоза толстой кишки 39
1.2.2. Ген APC и его функции 43
1.2.3. Мутации в гене APC у пациентов с семейным аденоматозом 46 толстой кишки
1.2.4. Генетико-фенотипические корреляции при семейном аденоматозе 48 толстой кишки
1.2.5. Клинический мониторинг и лечебная тактика у пациентов с 50 семейным аденоматозом толстой кишки
1.2.6. MutYH-ассоциированный полипоз 55
1.3. Гамартомные полипозные синдромы 57
1.3.1. Клиническая картина пациентов с синдромом Пейтца-Егерса 57
1.3.2. Молекулярные нарушения в гене STK11 у пациентов с синдромом 62 Пейтца-Егерса
1.3.3. Генетико-фенотипические корреляции при синдроме Пейтца- 63 Егерса
1.3.4. Клинический мониторинг и лечебная тактика у пациентов с 64 синдромом Пейтца-Егерса
1.3.5. Ювенильный полипозный синдром 65
1.3.6. Синдром Коудена 67
ГЛАВА 2. Материалы и методы 70
2.1. Материалы исследования 70
2.1.1. Пациенты, отобранные с целью обнаружения возможного 70 синдрома Линча
2.1.2. Пациенты с разными формами аденоматозного полипоза 71
2.1.3. Пациенты с синдромом Пейтца-Егерса 71
2.1.4. Группа контроля 72
2.2. Методы исследования з
2.2.1. Выделение геномной ДНК из перефирической крови и 72 операционного материала
2.2.2. Выделение геномной ДНК из парафиновых блоков 73
2.2.3. Выделение РНК из крови 75
2.2.4. Проведение реакции обратной транскрипции 75
2.2.5. Проведение полимеразной цепной реакции 76
2.2.6. Оценка качества ПЦР 84
2.2.7. Образование гетеродуплексных фрагментов ДНК 84
2.2.8. Денатурация фрагментов ДНК при использовании метода SSCP 84
2.2.9. Конформационно – чувствительный гель электрофорез
2.2.10. Метод SSCP 85
2.2.11. Окраска геля 86
2.2.12. Автоматическое секвенирование по Сэнгеру 86
2.2.13. Фрагментный анализ 87
2.2.14. Секвенирование нового поколения 87
2.2.15. Анализ функционального значения некоторых вариантов в 88 исследованных генах
2.2.16. Статистическая обработка результатов 88
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 90
3.1. Поиск герминальных мутаций у пациентов с разными наследственными формами колоректального рака
3.2. Разработка собственных критериев отбора российских пациентов с колоректальным раком с целью выявления синдрома Линча
3.2.1. Исследование пациентов с отягощенным семейным анамнезом
3.2.2. Исследование пациентов со спорадической формой колоректального рака
3.2.3. Исследование объединенной выборки пациентов с колоректальным раком
3.2.4. Исследование пациентов с колоректальным раком, отобранных с помощью предложенных критериев поиска
3.3. Частота и спектр наследственных мутаций в генах системы репарации ДНК
3.4. Отношение генотип-фенотип у пациентов с герминальными мутациями в генах системы репарации
3.5. Клинические особенности течения онкологических заболеваний у пробандов с синдромом Линча
3.6. Частота и спектр наследственных мутаций в гене APC у пациентов с наличием более 100 аденоматозных полипов
3.7. Отношение генотип-фенотип у пациентов с наличием более 100 аденоматозных полипов и герминальными мутациями в гене APC
3.8. Герминальные мутации в гене APC у пациентов с наличием менее аденоматозных полипов
3.9. MutYH - ассоциированный полипоз 162
3.10. Молекулярно-генетическое и фенотипическое исследование пациентов с синдромом Пейтца-Егерса
3.11. Алгоритм молекулярно-генетической диагностики и терапии пациентов с наследственными формами колоректального рака
Заключение 177
Выводы 186
Применение результатов и научных выводов 188
Список опубликованных работ по теме 190
Диссертации
Список литературы
