Введение
ГЛАВА I. РЕПРЕССОРЫ сі и CRO-КОМПОНЕНТЫ РЕШНТОРНОЙ
СИСТЕМЫ БАКТЕРИОФАГА X 8
1.1. Молекулярный триггер в бактериофаге А 8
1.2. Кристаллическая структура сго-репрессора 16
1.3. Структура и-концевого домена cl-penpeccopa. Взаимодействие с ДНК 19
ГЛАВА 2. ГОМОЛОГИИ. В СТРУКТУРАХ. РЖУЛЯТОРШХ. БЕЛКОВ
ТРАНСКРИПЦИИ 24
2.1. АМР-зависимый активатор катаболитных . генов... 24
2.2. Общие черты кристаллических структур 30
2.3. Аминокислотные последовательности и
вторичные структуры 32
ГЛАВА 3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДІ ИССЛЩВАНШ 39
3.1. Материалы и реактивы 39
3.2. Выделение сго-репрессора 39
3.3. Определение характеристик белка 48
3.4. КД- и УФ-спектроскопия 49
3.5. Спектроскопия ЯМР 50
3.5.1. Приготовление образцов 50
3.5.2. Запись спектров. Методики 51
3.6. Анализ кривых титрования 54
3.7. Измерение рН 54
ГЖВА 4. ВТОРИЧНАЯ СТРУКТУРА CRO-РЕПРЕССОРА 55
4.1. Анализ ашшокислотном последовательности.. . 55
4.2. Анализ данных КД 58
ГЖВА 5. ИЗУЧЕНИЕ МИКРООКРУЖЕНИЯ АМИНОКИСЛОТНЫХ
ОСТАТКОВ И ВНУТРИМОЛЕКУЛЯРНЫХ ВЗАИМО
ДЕЙСТВИЙ В CRO-РЕПРЕССОРЕ 70
5.1. Исследование состояний остатков тирозина с помощью абсорбционной спектроскопии 70
5.2. Изучение структуры ого-репрессора методом ЯМР 75
5.2.1. Отнесение сигналов в спектрах ЯМР 75
5.2.2. Изучение влияния ионизуемых.групп, Анализ кривых титрования 82
5.2.3. Доступность растворителю , гистидина-35 91
5.2.4. Идентификация внутримолекулярных взаимодействий с помощью.ядерного
эффекта Оверхаузера 93
ГЛАВА 6. СТРУКТУРА CRO-РЕПРЕССОРА В РАСТВОРЕ 107
ВЫВОДЫ 115
ЛИТЕРАТУРА 116
