Введение
ГЛАВА I Обзор литературы
1.1. Введение 19
1.2. Принципы полногеномных методов молекулярного анализа солидных опухолей 23
1.3. Роль постгеномных методов молекулярного анализа солидных опухолей
различных локализаций в идентификации подтипов и их патогенетических 29
особенностей 57
1.4. Геномная стратификация больных немелкоклеточным раком легкого на основании мутации EGFR
1.5. Возможности использования наследственных нарушений механизмов репарации, как метода геномной стратификации с целью повышения эффективности терапии
1.6. Роль комплексной оценки негативных предиктивных факторов, как метода геномной стратификации для оптимизации использования таргетной терапии 81
ГЛАВА II Материалы и методы исследования
2.1. Материалы и методы полногеномного экспрессионного профилирования дважды-позитивных опухолей молочной железы
2.2. Методика молекулярного анализа аденокарцином легкого и опухолей тела матки в 1 „ 1 рамках проекта The Cancer Genome Atlas Research Network
2.3. Материалы и методы исследования эффективности гефитиниба у больных
неплоско клеточным раком легкого с наличием наиболее частых активирующих 106
мутаций EGFR
2.4. Материалы и методы проспективного исследования эффективности монотерапии цисплатином в неоадъювантном режиме у носителей мутаций BRCA больных раком 120 молочной железы
2.5. Материалы и методы проспективного исследования эффективности митомицина С
у больных эпителиальными опухолями яичников, резистентными к стандартной 127
терапии с наследственными мутациями BRCA1
2.6. Материалы и методика проспективного нерандомизированного одноцентрового
исследования 2-й фазы по оценке влияния монотерапии цетуксимабом у больных
неоперабельным раком толстой кишки с «диким типом» RAS/RAF на время до Г34
прогрессировать опухоли
ГЛАВА III Молекулярное типирование опухолей с помощью полногеномных методов молекулярного анализа
3.1. Полногеномное экспрессионное профилирование дважды-позитивных опухолей 1 „ молочной железы
3.2. Изучение экспрессионного профиля дважды-позитивных опухолей молочной железы на независимой выборке публично доступных экспрессионных профилей
3.3. Результаты независимого анализа публичных данных 159
3.4. Комплексный анализ профиля молекулярных нарушений аденокарциномы легкого и рака тела матки
ГЛАВА IV Енетическая стратификация чувствительности опухолей легкого к таргетным ингибиторам на основании наличия мутаций EGFR
ГЛАВА V. Геномная стратификация на основании маркеров чувствительности к цитостатической терапии
5.1. Результаты проспективного нерандомизированного исследования эффективности монотерапии цисплатином у больных раком молочной железы носителей мутации BRCA1
5.2. Результаты проспективного нерандомизированного исследования эффективности митомицина с у больных раком яичников с мутацией BRCA1, резистентным к оп стандартной терапии
ГЛАВА VI Геномная стратификация больных для лечения анти-egfr моноклональными антителами на основании негативных предиктивных факторов чувствительности
6.1. Определение частоты мутаций генов KRAS, NRAS и BRAF у больных неоперабельным и метастатическим раком толстой кишки
6.2. Результаты проспективного моноцентрового однорукавного исследования эффективности монотерапии цетуксимабом в первой лечебной линии у больных раком 203 толстой кишки без мутации генов RAS/RAF
6.3. Токсичность монотерапии цетуксимабом у больных неоперабельным раком толстой кишки с «диким типом» RAS/RAF
6.4. Статистический и корреляционный анализ токсических проявлений и показателей эффективности монотерапии цетуксимабом у больных раком толстой кишки без 215 мутаций в генах RAS/RAF
6.5. Оценка показателей общей выживаемости и эффективности следующих за цетуксимабом этапов лечения 220
ГЛАВА VII Формирование алгоритма индивидуализации лечения больных солидными опухолями на основании молекулярно- генетических особенностей
Обсуждение полученных результатов 232
Выводы 261
Список использованной литературы
