ВВЕДЕНИЕ...................................................................................................................... 4
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ .............................................................................. 11
1.1. Гибридизация.......................................................................................................... 11
1.1.1. Причины и механизмы межвидовой гибридизации ........................................ 11
1.1.2. Гибридизация в природе..................................................................................... 15
1.1.3. Гибридизация в трибе Marmotini....................................................................... 21
1.1.4. Комплекс гибридизирующих видов Spermophilus........................................... 25
1.2. Филогеография ....................................................................................................... 29
1.2.1. Влияние палеоклиматических событий и эколого-географических барьеров
на филогеографическую структуру видов млекопитающих .................................... 29
1.2.2. Филогеография наземных беличьих ................................................................. 33
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ.......................................................................... 39
2.1. Материал ................................................................................................................. 39
2.2. Полевые методы сбора материала........................................................................ 41
2.3. Молекулярно-генетические методы исследования ............................................ 43
2.4. Анализ молекулярно-генетических данных........................................................ 48
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ............................................................................................. 53
3.1. Внутривидовая изменчивость S. major на основе маркеров мтДНК без учета
интрогрессированных гаплотипов............................................................................... 54
3.2. Внутривидовая изменчивость S. major на основе маркеров мтДНК и яДНК с
учетом интрогрессированных гаплотипов ................................................................. 61
3.2.1. Изменчивость маркеров мтДНК........................................................................ 61
3.2.2. Изменчивость маркеров яДНК .......................................................................... 65
3.2.3. Анализ консенсусной последовательности 3 ядерных генов......................... 713
3.2.4. Анализ гаплотипического разнообразия S. major............................................ 72
ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ........................................................................................... 74
4.1. Характеристики митохондриального генома S. major....................................... 74
4.1.1. Собственный митохондриальный геном S. major............................................ 74
4.1.2. Филогеография S. major...................................................................................... 75
4.2. Интрогрессия в комплексе гибридизирующих видов Spermophilus................. 77
4.2.1. Влияние гибридизации на генофонд S. major.................................................. 77
4.3. Направленность интрогрессивного замещения митохондриальных геномов . 81
4.4. Реконструкция истории формирования современной генетической структуры
S. major............................................................................................................................ 82
ГЛАВА 5. ЗАКЛЮЧЕНИЕ........................................................................................... 87
ВЫВОДЫ....................................................................................................................... 89
БЛАГОДАРНОСТИ ...................................................................................................... 90
ПУБЛИКАЦИИ АВТОРА............................................................................................ 91
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ............................................................................................. 94
ПРИЛОЖЕНИЕ........................................................................................................... 114
