Введение
Глава 1. Основные подходы к использованию молекулярных данных для реконструкции филогении 7
1.1. Сравнительный вклад молекулярных и морфологических признаков при реконструкции филогении 7
1.2. Участки генома, используемые для филогенетических реконструкций на низком таксономическом уровне; выбор участков для данной работы 13
1.2.1. Участок ITS ядерной рибосомной ДНК 14
1.2.2. Участок p^A-ґгяН хлоропластной ДНК 20
1.3. Выравнивание последовательностей 27
1.4. Методы реконструкции филогенетических деревьев и оценки достоверности узлов дерева 31
1.4.1. Дистанционные методы 34
1.4.2. Метод максимальной экономии 35
1.4.3. Метод максимального правдоподобия 40
1.4.4. Метод Байеса 42
1.4.5. Способы оценки достоверности узлов дерева 44
Глава 2. Обзор работ по систематике и филогении исследуемых групп семейств бобовые (Leguminosae) и зонтичные (Umbeliferae): соотношение молекулярных и традиционных подходов 48
2.1. Триба Loteae семейства бобовые (Leguminosae) 48
2.2. Род Bunium (Umbelliferae) и родственные ему таксоны 55
Глава 3. Материалы и методы 60
3.1. Исходный материал 60
3.2. Выделение ДНК 60
3.3. Амплификация ДНК 61
3.4. Агарозный гель-электрофорез 62
3.5. Очистка ПЦР-продукта и секвенирование 63
3.6. Выравнивание и методы филогенетического анализа 63
Глава 4. Результаты и обсуждение 66
4.1. Филогенетический анализ представителей трибы Loteae семейства бобовые (Leguminosae) 66
4.1.1. Характеристика ITS яд-рДНК 67
4.1.2. Анализ данных о последовательностях ITS яд-рДНК 70
4.1.3. Анализ объединенных данных по ITS и морфологии 86
4.1.4. Характеристика спейсера/и&А-/гяН хпДНК 92
4.1.5. Анализ последовательностей спенсера psbA-trnH хпДНК 94
4.2. Филогенетические связи рода Bunium семейства зонтичные (Umbelliferae) 98
4.2.1. Характеристика ITS яд-рДНК 98
4.2.2. Анализ последовательностей ITS яд-рДНК 101
4.2.3. Кладистический анализ морфологических данных 114
4.2.4. Характеристика спейсеръ psbA-trnH хпДНК 118
4.2.5. Анализ последовательностей спейсера/и6А-/п?Н хпДНК 119
Заключение 124
Выводы 131
Список литературы 132
Приложение
