Введение
1 Обзор литературы 6
1. Pscudomonas aeruginosa как условный патоген 6
2. Классификация бактериофагов P. aeruginosa 8
2.1. Морфология бактериофагов P. aeruginosa 8
2.2. Гомология геномов бактериофагов P. aeruginosa 10
3. Модульная теория и эволюция бактериофагов 13
3.1. Модульная теория эволюции 13
3.2. Супергруппы бактериофагов 15
3.2.1. Фаги-транспозоны 16
3.2.2. Т4-подобные бактериофаги 17
3.2.3. Т7-подобные бактериофаги 19
4. Фаготерапия 21
4.1. Использование бактериофагов P. aeruginosa в фаготерапии 22
4.2. Проблемы использования живых вирулентных бактериофагов в фаготерапии 23
4.2.1. Общая и специализированная трапсдукция 24
4.2.2. Фаговая конверсия 25
4.2.3. Псевдолнзогения 25
5. Бактериофаг (J)KZ P. aeruginosa 27
5.1. Биологические свойства бактериофага KZ 27
5.2. Структура частицы бактериофага ([)KZ 28
5.3. Геном фага cJiKZ 30
5.3.1. Основные свойства и организация генома 30
5.3.2. Предполагаемые промоторы и терминаторы 32
5.3.3 Внрус-кодирусмые тРНК 33
5.4. Предполагаемые генные продукты бактериофага 34
5.4.1. Сходство генных продуктов фага (J>KZ с известными белками 34
5.4.2. Интрои-коднруемые эпдонуклеазы 40
5.4.3. Генные продукты, вовлеченные в метаболизм нуклеотндов 41
5.4.4. Репликация ДНК 42
5.4.5. Белки фага ^KZ, родственные белкам других бактериофагов 42
5.4.6. Белки фаговой частицы KZ 43
5.5. Бактериофаги группы KZ 44
2 Экспериментальная часть 46
3 Материалы и методы 46
3 Результаты и обсуждение 54
1.ФКг-подобньіе бактериофаги 54
1.1. Сравнение биологических свойств фагов 54
1.1.1. Бактериофаги и их происхождение 54
1.1.2. Выделение новых фК2-подобных бактериофагов 55
1. 1.3. Фенотип негативных колоний фагов 55
1.1.4. Сравнение морфологии фаговых частиц 56
1.1.5. Псевдолизогения 56
1.1.6. Спектр литической активности 58
1.1.7. Способность к общей трапедукцни 61
1.1.8. Инактивация сывороткой 62
1.2. Сравнение геномов фК2-подобных фагов 63
1.2.1. Сравнение размеров геномов 63
1.2.2. Сравнение рестрикціїошіьгх профилей ДНК 63
1.2.3. Определение гомологии ДНК 66
1.3. Сравнение полнпептндного состава зрелых частиц 71
1.4. Некоторые особенности предполагаемых генііьіх продуктов фага фК2 73
1.5. Обсуждение 75
1.5.1 .Эволюция группы (JiKZ-ггодобных бактериофагов 75
1.5.2. Возможность использования фК^подобных фагов в фаготерапии 78
2.Бактериофаг фКМУ 81
2.1. Биологические свойства фага фКМУ 81
2.1.1. Выделение фагафКМУ и внешние признаки негативных колоний 81
2.1.2. Морфология фаговых частиц 81
2.1.3. Спектр литической активности 82
2.1.4. Рост и развитие фага 82
2.2. Изучение генома фага фКМУ 82
2.2.1. Размер и GC-состав генома 83
2.2.2. Рсстрикционнын анализ ДНК 83
2.2.3. Характеристика генома фКМУ, полученная на основе анализа полной последовательности ДНК 86
2.3. фКМУ-подобные бактериофаги 89
2.3.1. Выделение новых (J>KMV-подобных бактериофагов 89
2.3.2. Морфология фаговых частиц 90
2.3.3. Изучение генома новых фКМУ-подобных бактериофагов 90
2.3.4. Спектр лнтнческой активности 92
2.3.5. Феномен взаимодействия фКМУ-подобных и некоторых ([iKZ-ггодобных фагов 94
2.4. Обсуждение 95
2.4.1. Эволюция фКМУ-подобных фагов 95
2.4.2. Возможное практическое применение фагов вида фКМ-V 97
Выводы 98
