Введение
ГЛАВА 1 Микробиологическая характеристика энтеропатогенных иерсиний и лабораторная диагностика (обзор литературы) 14
1.1 Общая характеристика и таксономия рода Yersinia 14
1.2 Факторы патогенности иерсиний и некоторые аспекты патогенетических механизмов 21
1.3 Распространенность энтеропатогенных иерсиний и их лабораторная диагностика 30
ГЛАВА 2 Материалы и методы исследования 47
2.1. Материалы 47
2.1.1 Сведения о лабораторных исследованиях 47
2.1.2 Клинический и полевой материал 47
2.1.3 Штаммы Y. pseudotuberculosis и Y. enterocolitica 48
2.2. Методы исследования 48
2.2.1 Бактериологический метод 48
2.2.2 MALDIoF масс-спектрометрический анализ 50
2.2.3 Полимеразная цепная реакция 51
2.2.3.1 Определение факторов патогенности 52
2.2.4 О-серогенотипирование 55
2.2.5 VNTR-анализ 55
2.2.6 Пульс-электрофорез (PFGE-анализ) 56
2.2.7 Статистические методы з
ГЛАВА 3 Собственные исследования совершенствование микробиологического мониторинга y. pseudotuberculosis и y. enterocolitica на основе применения молекулярно-генетических методов исследования 59
3.1 Анализ состояния лабораторной диагностики Y.pseudotuberculosis и Y. enterocolitica в центрах гигиены и эпидемиологии изучаемого региона 59
3.2 Оптимизация схемы лабораторного исследования при проведении микробиологического мониторинга энтеропатогенных иерсиний 72
3.3 Оценка молекулярно-генетических методов
исследования при вспышках псевдотуберкулеза 83
ГЛАВА 4 Фенотипические и молекулярно-генетические свойства y. pseudotuberculosis и y.enterocolitica, изолированных в сибири и на дальнем востоке 93
4.1 Изучение фенотипических и генотипических свойств Y.pseudotuberculosis 93
4.2. Молекулярно-биологическая характеристика штаммов Y.enterocolitica 103
ГЛАВА 5 Алгоритм трехуровневой системы лабораторных исследований на энтеропа тогенные иерсинии 113
Заключение 121
Выводы 132
Список сокращений 134
Список литературы
