Введение
ГЛАВА 1. Литературный обзор 4
1.1 Упаковка длинных а-спиралей в белках 4
1.2 Гидрофильные взаимодействия в белках 21
ГЛАВА 2. Результаты и обсуждения 39
2.1 Постановка задачи 39
2.2 Спрятанные гидрофильные остатки в белках как фактор, определяющий нативную упаковку спиралей 40
2.3 Стереохимический анализ гидрофильных взаимодействий в а-спиральных белках с различными упаковками а-спиралей...53
2.4 Взаимосвязь между геометрическими параметрами межспиральных водородных и солевых связей и типами остатков, которые в них участвуют 62
2.5 Моделирование «нативных» и «ненативных» межспиральных взаимодействий 75
2.6 Вероятность образования разных типов межсииральных связей. Вероятность образования межспиральных солевых мостиков в зависимости от доступности заряженных остатков. Доступность доноров и акцепторов в межспиральных связях 90
Основные результаты и выводы 92
Список литературы 93
