Введение
1. Введение 5
2. Литературный обзор
Строение O-специфических полисахаридов энтеробактерий 8
2.1. Общие аспекты 8
2.2. Состав O-полисахаридов 11
2.3. Строение О-полисахаридов
2.3.1. Salmonella 13
2.3.2. Citrobacter, Edwardsiella 20
2.3.3. Escherichia, Shigella 24
2.3.4. Klebsiella, Raoultella 32
2.3.5. Serratia 32
2.3.6. Hafnia 33
2.3.7. Pantoea, Franconibacter, Enterobacter, Cronobacter 40
2.3.8. Proteus, Providencia, Morganella 41
2.3.9. Yersinia
2.3.10. Plesiomonas 52
2.3.11. Другие роды 52
3. Результаты и их обсуждение 57
3.1. Строение О-полисахаридов 57
3.1.1. Полисахариды Enterobacter cloacae 57
3.1.2. Полисахариды Escherichia coli. 64
3.2. Характеристика генных кластеров О-антигенов 67
3.2.1. Генные кластеры Enterobacter cloacae 68
3.2.2. Генные кластеры Escherichia coli. 71
3.3. Структурный анализ О-полисахаридов 74
3.3.1. Выделение и деградация липополисахаридов 75
3.3.2. Компонентный анализ полисахаридов 75
3.3.3. Химические модификации полисахаридов
3.3.3.1. О-Дезацетилирование 77
3.3.3.2. Дезацеталирование 78
3.3.4. Анализ методом метилирования 78
3.3.5. Избирательное расщепление полисахаридов 79
3.3.5.1. Мягкий кислотный гидролиз 79
3.3.5.2. Распад по Смиту 79
3.3.5.3. Сольволиз трифторуксусной кислотой
3.3.6. Спектроскопия ЯМР 84
3.3.7. Масс-спектрометрия 84
3.3.8. Пример установления структуры О-полисахарида E. coli O39
3.4. Получение олигосахаридных фрагментов ОПС Shigella flexneri 92
3.5. Заключение 95
4. Экспериментальная часть 98
4.1. Бактериальные штаммы и выращивание 98
4.2. Выделение липополисахаридов и О-полисахаридов 98
4.3. Определение состава полисахаридов
4.3.1. Анализ моносахаридов методом ГЖХ в виде ацетатов полиолов 100
4.3.2. Определение абсолютных конфигураций компонентов
4.4. Метилирование 101
4.5. Избирательное расщепление
4.5.1. Сольволиз трифторуксусной кислотой 102
4.5.2. Распад по Смиту
4.6. Масс-спектрометрия с ионизацией электрораспылением 103
4.7. Спектроскопия ЯМР 103
5. Выводы 110
Список литературы
