Введение
Глава 1. Обзор литературы 12
1.1. Изучение генетического разнообразия в популяциях человека 12
1.2. Методы исследования ядерной ДНК 14
1.2.1 Метод главных компонент 15
1.2.2. Молекулярная хромосомная живопись 16
1.2.3. Трёхпопуляционный тест и f-статистика 19
1.2.4. Неравновесное сцепление генов при эволюционных событиях и ALDER 21
1.3. Методы исследования митохондриальной ДНК 23
1.3.1. Номенклатура митохондриальных гаплогрупп 23
1.3.2. Филогеография 25
1.3.3. Молекулярные часы эволюции
1.4. Древняя Берингия 28
1.5. Описание популяций
1.5.1. Чукчи 32
1.5.2. Сибирские эскимосы 32
1.5.3. Командорские алеуты
1.6. Предыстория коренных жителей сибирской и американской Арктики 35
1.7. Заключение 41
Глава 2. Материалы и методы 43
2.1. Величина и состав выборки 43
2.2. Оборудование 44
2.3. Реактивы 45
2.4. Выделение ДНК из цельной крови 47
2.5. Полимеразная цепная реакция 47
2.6. Электрофорез ДНК в агарозном геле 48
2.7. Секвенирование мтДНК 48
2.8. Анализ результатов секвенирования мтДНК 48
2.9. Оценка возраста митохондриальных гаплогрупп 49
2.10. Анализ главных компонент 50 2.11. Вычисление значений f-статистики 50
2.12. Вычисление значений ALDER-статистики 50
2.13. Анализ ADMIXTURE 51
2.14. Автоматизация вычислений и визуализация результатов 51
Глава 3. Результаты 52
3.1. Геномная изменчивость ядерной ДНК 52
3.2. Геномная изменчивость митохондриальной ДНК 61
3.3. Гаплогруппы A2a и A2b 62
3.4. Гаплогруппа D4b1a2 65
3.5. Гаплогруппа D2a 66
Глава 4. Обсуждение 68
4.1. Береговые чукчи 68
4.2. Палеоэскимосы и неоэскимосы 69
4.3. Командорские алеуты 71
Глава 5. Заключение 73
Выводы 75
Список литературы
