Введение
1. Обзор литературы 10
1.1. Структура и функциональные особенности синдекана-1 10
1.1.1. Семейство синдеканов 10
1.1.2. Строение синдекана-1 14
1.1.3. Образование «растворимой» формы синдекана -1 15
1.1.4. Альтернативные экзоны синдекана-1 19
1.2. Атеросклероз и факторы риска его развития 20
1.2.1. Строение эндотелиального гликокаликса .22
1.2.2. Роль синдекана-1 в перестроении цитоскелета эндотелиальных клеток под действием напряжения сдвига .25
1.2.3. Роль синдекана-1 в миграции лейкоцитов .27
1.2.4. Транспорт холестерина и метаболизм липопротеинов 28
1.2.5. Синдекан-1 – рецептор печени, связывающий липопротеины с высоким содержанием триглицеридов .32
1.2.6. Мышиные линии С57Black и АпоЕ-/- 34
1.3. Структура полифункциональных белков 34
1.3.1. Компьютерные методы предсказания структуры белка 35
1.3.2. Предсказание вторичной структуры 36
1.3.3. Предсказание третичной структуры белка 38
1.3.4. Предсказание нативно-неструктурированных белков .39
2. Материалы и методы
2.1. Определение группы экспериментальной мышей .42
2.2. Макроскопический анализ дуги аорты у С57Black и АпоE-/- мышей .43
2.3. Выделение РНК .43
2.4. Синтез первой цепи кДНК 45
2.5. Определение уровня экспрессии гена синдекана-1 45
2.6. Измерение концентрации растворимого фрагмента синдекана-1 в сыворотке крови у С57Black и АпоE-/- мышей 47
2.7. Биохимический анализ сыворотки крови у С57Black и AпoE-/- мышей. 49
2.8. Предсказание пространственной структуры белков семейства синдеканов .51 2.9. Статистическая обработка данных 51
3. Результаты и обсуждение .52
3.1. Макроскопический анализ дуги аорты С57Black и AпoE-/- мышей 52
3.2. Анализ данных измерения уровня экспрессии гена синдекана-1 54
3.3. Результаты измерения концентрации растворимого фрагмента синдекана-1 в сыворотке крови у С57Black и AпoE-/- мышей 57
3.4. Результаты измерения биохимических параметров сыворотки крови исследуемых мышей 60
3.5. Предсказание вторичной структуры и пространственной структуры отдельных доменов коровых белков синдеканов .61
3.6. Обсуждение результатов 68
3.7. Заключение 73
4. Выводы 74
Благодарности 74
Список литературы
