Введение
ГЛАВА 1. Обзор литературы 15
1.1. Характеристика исследуемых объектов 13
1.2. Основные характеристики и особенности исследуемых групп водорослей
1.2.1. Ostreopsis Shmidt, 1902 19
1.2.2. Scrippsiella trochoidea (Stein) Balech ex A.R and Loeblich III, 1976
1.2.3. Dinophysis Ehrenberg, 1839 24
1.2.4. Prorocentrum Ehrenberg, 1834 26
1.2.5. Гаптофитовые водоросли (Haptophyta), или Примнезиофиты –
Prymnesiophyta 27
1.2.6. Красные водоросли (Rhodophyta): Porphyridium purpureum (Bory de Saint-Vincent) K.M.Drew et R.Ross, 1965 29
1.2.7. Отдел Цианобактерии
(Cyanobacteria, Cyanophyta, Cyanoprokaryota) 30
1.3. Степень изученности и проблематика молекулярно-генетической идентификации у микроводорослей и цианобактерий 34
1.4. Молекулярно-генетические маркёры в идентификации и установлении родственных связей морских микроводорослей и цианобактерий.. 41
1.5. Методы, используемые в установлении родственных связей и филогенетического положения у микроводорослей и цианобактерий 50
ГЛАВА 2. Материалы и методы исследования
2.1. Материал исследования .56
2.2. Выделение ДНК
2.2.1. Выделение ДНК с применением СТАВ по Doyle, Doyle (1990) с модификациями 56
2.2.2. Выделение ДНК на основе HotSHOT 61
2.2.3. Выделение ДНК на основе хелатирующей смолы Chelex 100 61
2.2.4. Выделение ДНК из одной клетки «single-cell» .62
2.3. ПЦР 63
2.4. Электрофорез в агарозном геле 65
2.5. Приготовление компетентных клеток Escherichia coli для молекулярного клонирования 66
2.6. Молекулярное клонирование .68
2.7. Секвенальная реакция
2.8. Редактирование и сборка хроматограмм, выравние последовательностей 71
2.9. Попарное и множественное выравнивание последовательностей 72
2.10. Реконструкции филогенетических деревьев 72
ГЛАВА 3. Результаты и обсуждение .76
3.1. Ostreopsis sp. ORUS 76
3.2. Scrippsiella trochoidea 86
3.3. Dinophysis acuminata 89
3.4. Prorocentrum foraminosum 90
3.5. Tisochrysis lutea 97
3.6. Porphyridium purpureum 103
3.7. Cyanobacteria 107
3.8. Возможные причины внутривидовой, внутрииндивидуальной (внутригеномной) вариабельности рДНК, затрудняющих молекулярно-генетический анализ микроводорослей 113
Заключение 120
Выводы 123
Список литературы
