Введение
Глава 1. Экология вируса клещевого энцефалита: климатогеографические особенности и структура природных очагов вируса клещевого энцефалита в Евразии 19
Глава 2. Фенотипическая и генотипическая вариабельность вируса клещевого энцефалита 47
Глава 3. Материалы и методы 77
3.1. Материалы исследования 77
3.1.1. Вирусы 77
3.1.2. Иксодовые клещи 83
3.1.3. Пробы крови и образцы сыворотки крови 85
3.1.4. Иммунные сыворотки 85
3.1.5. Клеточные культуры 86
3.1.6. Зонды, используемые в реакции МГНК 86
3.1.7. Статистические данные по заболеваемости 87
3.2. Методы исследования 88
3.2.1. Вирусологические 88
3.2.2. Серологические 90
3.2.3. Бактериоскопические 92
3.2.4. Молекулярно-биологические 92
3.2.5. Статистические 98
Глава 4. Структура природных очагов клещевого энцефалита Восточной Сибири 99
4.1. Природно-климатические особенности и распространение очагов клещевого энцефалита в Восточной Сибири 99
4.2. Сочетанные очаги иксодовых клещевых инфекций в Восточной Сибири (на примере Иркутской области) 104
Глава 5. Генетические типы вируса клещевого энцефалита на территории Восточной Сибири 140
5.1. Генотипирование вируса клещевого энцефалита с помощью молекулярных зондов 140
5.2. Генотипирование на основе анализа последовательностей нуклеотидов вирусных геномов 148
5.3. Генотипирование методом ОТ-ПЦР в режиме реального времени с гибридизационно-флюоресцентной детекцией с генотипспецифическими зондами 172
5.4. Восточная Сибирь - уникальная территория обитания различных генотипов и геновариантов вируса клещевого энцефалита 180
Глава 6. Фенотипические различия штаммов вируса клещевого энцефалита, выделенных на территории востОчной Сибири 186
6.1. Внутривидовые антигенные различия восточносибирски штаммов вируса клещевого энцефалита 186
6.2. Генетические признаки, определяемые "in vitro" 199
6.3. Генетические признаки, связанные с вирулентностью 207
Глава 7. Эколого-географические аспекты генетической вариабельности вируса клещевого энцефалита в Восточной Сибири 221
7.1. Дислокация и эколого-географическая характеристика мест изоляции вируса клещевого энцефалита 221
7.2. Распространение генотипов вируса клещевого энцефалита в различных типах ландшафтов Восточной Сибири 226
7.3. Генотипы штаммов вируса клещевого энцефалита, изолированных из иксодовых клещей и различных видов позвоночных животных 243
Глава 8. Этиология клещевого энцефалита в восточной сибири и вопросы повышения эффективности диагностики и профилактики в свете данных о высоком уровне вариабельности возбудителя 258
8.1. Генотипы штаммов вируса клещевого энцефалита и изолятов РНК, выделенных от больных людей и лиц, пострадавших от присасываний инфицированных клещей 258
8.2. Вопросы повышения эффективности диагностики профилактики клещевого энцефалита в свете данных о высоком уровне вариабельности возбудителя 269
Заключение 279
Выводы 299
Список использованной литературы
