Введение
ГЛАВА 1. Обзор литературы 10
1.1. История открытия бокавирусов 10
1.2. Таксономия семейства Parvoviridae 11
1.3. Организация генома HBoV 13
1.4. Свойства и функции белков парвовирусов 15
1.5. Структура вириона бокавирусов человека 19
1.6. Репликация HBoV 23
1.7. Транскриптом парвовирусов 28
1.8. Жизненный цикл HBoV 30
1.9. Генетическая дивергенция бокавирусов человека
1.10. Патогенез бокавирусной инфекции 33
1.11. Персистенция бокавирусов в организме человека 34
1.12. Пути передачи бокавирусов человека 35
1.13. Лечение и профилактика HBoV инфекции 35
1.14. Диагностика бокавирусной инфекции 37
1.15. Эпидемиология бокавирусной инфекции 38
1.16. Заключение 43
ГЛАВА 2. Пациенты, материалы и методы 45
2.1. Основная характеристика обследованных больных 45
2.2. Материалы 46
2.3. Основные методы
2.3.1. Сбор образцов 47
2.3.2. Осветление экстракта фекалий 47
2.3.3. Выделение вирусной ДНК 47
2.3.4. Проведение полимеразной цепной реакции (ПЦР) 48
2.3.5. Электрофоретический анализ образцов 49
2.3.6. Проведение полимеразной цепной реакции с гибридизационно-флуоресцентной детекцией «по конечной точке» 49
2.3.7. Очистка продуктов ПЦР 50
2.3.8. Постановка реакции Сэнгера 50
2.3.9. Очистка продуктов реакции Сэнгера
2.3.10. Филогенетический анализ 51
2.3.11. Статистический анализ 51
2.3.12. Анализ нуклеотидных последовательностей 52
2.3.13. Определение скорости молекулярой эволюции 53
ГЛАВА 3. Результаты 54
3.1. Исследование эпидемических особенностей бокавирусной инфекции человека в Новосибирске 54
3.2. Генотипирование изолятов бокавирусов, выявленных в Новосибирске 57
3.3. Секвенирование геномов изолятов бокавирусов, выявленных в Новосибирске 62
3.4. Анализ рекомбинационных событий в геномах HBoV 71
3.5. Оценка скорости молекулярной эволюции HBoV 74
3.6. Исследование особенностей репликации HBoV 80
ГЛАВА 4. Обсуждение результатов 92
Выводы 105
Список использованной литературы
