Введение
1. Трансляционная аттенюация (трансляция лидерного пептида) 17
1.1. trp оперон E. coli и другие опероны биосинтеза аминокислот энтеробактерий 17
1.2. Экспрессия pyrBI E. coli 20
2. Регуляция с участием РНК-связывающего белка 21
2.1. РНК-связывающие белки, стимулирующие терминацию 21
2.2. РНК-связывающие белки, стимулирующие антитерминацию 25
3. T-бокс регуляция у грамположительных бактерий 28
4. Рибопереключатели 33
4.1. История открытия 33
4.2. Разнообразие рибопереключателей 36
Материалы и методы 44
Результаты и обсуждение 56
Введение 56
1. Регуляция экспрессии генов синтеза McC 58
1.1. Транскрипт mccA необходим для продукции микроцина С 58
1.2. Короткий транскрипт микроцинового оперона mccA чрезвычайно стабилен и связан с рибосомами in vivo 61
1.3. In vitro анализ терминации транскрипции в межгенном участке mccA-mccB 64
2. Трансляционная аттенюация в других mcc оперонах 74
3. Регуляция экспрессии и роль генов иммунности в синтезе McC 84
3.1. Особенности регуляции экспрессии mccF 85
3.2. Влияние инактивации белков иммунности на скорость роста клеток-продуцентов McC 87
3.3. Влияние MccF на продукцию McC з
4. Внутренние промоторы оперона mcc 95
4.1. Оперон mcc содержит внутренние промоторы 95
4.2. Картирование потенциальных внутренних промоторов оперона mcc in vivo 97
4.3. Картирование активных внутренних промоторов оперона mcc in vivo методом полнотранскриптомного секвенирования 99
4.4. Проверка активности выбранных промоторов in vitro 101
Заключение 104
Выводы 105
Благодарности 106
Список литературы 107
