Введение
Глава 1. Обзор литературы 14
Мобильные элементы генома 14
Класс I – ретроэлементы 16
Класс II – ДНК- транспозоны 19
Транспозон mariner 23
Модельный объект исследования — Himasthla elongata (Trematoda, Echinostomatidae) 33
Методы определения генетического полиморфизма 37
Глава 2. Материалы и методы 40
Сбор и первичная обработка материала 40
Выделение геномной ДНК 40
Выделение РНК. 42
Полимеразная Цепная Реакция (ПЦР). 42
ПЦР совмещенная с обратной транскрипцией 44
Клонирование и секвенирование. 44
Введение меченых нуклеотидов в последовательности ДНК 45
Гибридизация по Саузерну, дот-блот гибридизация. Получение препаратов ядер и определение размера генома H. elongata 46
Флуоресцентная гибридизация in situ (FISH) 46
Электрофорез 47
AFLP и TID 48
Компьютерные методы исследований 49
Статистическая обработка результатов AFLP 49
Глава 3. Результаты 50
Выявление представителя семейства транспозонов mariner в геноме Himasthla elongata 50
HemarI-подобные транспозоны в геномах эукариот 61
Вариабельность геномов партенит и церкарий H. elongata и использование транспозона HemarI для ее выявления . 64
Глава 4. Обсуждение 72
Субсемейство элемента hemar1 72
Горизонтальный перенос на основе mariner 74
Векторы на основе транспозонов 77
Транспозоны внутри генома и связь с типом размножения 79
Клональная изменчивость партенит 82
Выводы 85
Цитированная литература
